大肠杆菌O104是一个日益众所周知且麻烦的新兴多样致病菌株。病原体引起出血性腹泻，以及潜在的致命肾脏损伤和溶血性尿毒综合征。感染通常是通过无意中摄取被污染的和不完全煮熟的食物及其它物质，如动物粪便。

大肠杆菌是一种所谓的革兰氏阴性菌，通常在人类和其他哺乳动物的肠道中被发现。肠出血性菌株包括O157，O26，O103和O111，特别是O157：H7的子株是北美、英国和日本食源性疾病的重要诱因。

一个被印度研究人员在国际杂志生物信息学研究与应用（Bioinformatics Research and Applications）上着重指出的特别菌株，O104:H4，会引起严重的并发症，并已形成明显的多药耐药性。此外它还通过水平转移的方式从其他菌株获得基因，从而使它变得毒性更强。

来自于泰米尔纳德邦马杜赖的马杜赖拉伊大学的研究团队，与卡纳塔克邦基因科技有限公司的同事一道，利用计算分子生物学的工具来识别这样的38种基因水平转移因素，噬菌体因素。研究团队解释这些元素是保护细菌免遭抗生素危害的基因武器，并来自于病毒，即所谓感染细菌的噬菌体。

这株大肠杆菌超过四分之一的基因组中含有噬菌体元素，研究小组解释说。这些元素也参与生产致命化合物如志贺菌毒素，它能引起许多感染症状。在某种意义上，它们可能会代表新的诊断标记物，甚至是开发新型抗生素——避免细菌所获得的保护性措施的靶标。