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身份识别又有新方法——人类微生物组“指纹”

Spongebob  发布于:2015/5/13  阅读量:707  来源:sciencedaily

一项新研究表明,人类体内和体表携带的微生物群落——被称作人体微生物组——具有唯一识别身份的潜能,就像人类的指纹一样。哈佛陈曾熙公共卫生学院的研究人员和同事们称:一项对数百人群体的研究显示,随着时间的推移,人体微生物组包含足够独特的特征来识别个体身份。这项研究首次严格证明了用微生物组数据来鉴别身份是可行的,表明我们有惊人的独特微生物群体,但也会使参加人类微生物组研究项目的受试者存在潜在的隐私问题。 


这项研究于2015年5月11日在线发表在《PNAS》杂志。


 “将人类DNA样本与人类DNA‘指纹’数据库关联起来是法医遗传学的基础,现在已经是一个根深蒂固的领域。我们的研究表明,不需要人类DNA,用栖居于人体的微生物的DNA序列进行相同类型的关联是可能的。这为人类微生物组样本和数据库之间的关联打开了大门,同时也存在暴露敏感的受试者信息的潜在风险,例如,从微生物样本检测到的性传播感染”,论文的主要作者Eric Franzosa (哈佛陈曾熙公共卫生学院生物统计系的研究员)说到。


Franzosa和他的同事们采集了通过人类微生物组计划(HMP)公开获得的微生物数据,这项调查耗时数月,受试者多达242人,研究人员从他们的粪便、唾液、皮肤和身体其他部位进行了收集。作者改编了经典计算机算法,将个体初始微生物组样本中稳定的和独特的序列特征转化为个体独特的“代码”。之后将这些代码与后续访问的相同个体微生物组样本及独立组群个体微生物组样本进行了比较。 


结果表明,这些代码在数百位受访个体中都是独一无二的,且大部分个体的微生物“指纹”在1年取样周期内保持稳定。由肠道样本构建的代码尤其稳定,超过80%的个体在采样周期后长达1年仍可以识别。


 “尽管由单纯微生物DNA带来任何数据隐私问题的可能性是非常低的,但对研究人员来说,重要的是他们要知道这一问题在理论上是可能的”,论文的另一主要作者——Curtis Huttenhower (哈佛陈曾熙公共卫生学院计算生物学和生物信息学副教授)说,“也许更令人兴奋的是研究微生态的影响,因为这表明栖居于人体的独特微生物群体在调节着我们的身体环境——遗传、饮食及发展历史——它们以这样的方式与我们一起坚持,在一段时间内帮助我们抵御不太友好的微生物入侵”。 


参考文献: Eric A. Franzosa, Katherine Huang, James F. Meadow, Dirk Gevers, Katherine P. Lemon, Brendan J. M. Bohannan, Curtis Huttenhower. Identifying personal microbiomes using metagenomics codes. PNAS, May 11, 2015  DOI: 10.1073/pnas.1423854112

全部评论(2)

  • 1楼
    2015/5/14 16:19:25genestory

    【精华】微生物组的功能越来越多样化了~

    [0]
  • 2楼
    2015/5/13 10:30:57游泳的熊

    除了指纹识别,还有微生物指纹识别,越来越先进了

    [0]

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