重测序专题研讨班通知
——实用生物信息学系列专题班
通过全基因组重测序的序列比对，研究者可以找到大量的单核苷酸多态性位点（SNP）、拷贝数变异（CNV）、插入缺失（InDel）、结构变异（SV）等变异位点。并通过对已知全基因组序列的物种进行测序，来研究个体或群体间的相关变异信息，从而找出与疾病、性状、以及功能有关的基因，进行个体或群体分子水平的差异分析。随着测序成本的大幅度降低以及测序效率的数量级提升，再加上已知基因组序列的物种增多，全基因组重测序已成为动植物物种遗传差异研究、功能基因挖掘等最可靠的方法。为了更好的服务于广大科研工作者的需要，北京市计算中心生物计算事业部举办“重测序”专题研讨班。每期名额有限，欢迎您参加！
主办单位：北京市计算中心
培训地点：北京海淀区丰贤中路7号3号楼，北京市计算中心三层会议室
培训时间：2014年4月2-4日
本次课程时间： 上午：9:30-11:30下午：13:30-16:30
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 重测序研究背景及理论 | ? 生物信息学知识背景概述； ? 二代测序的基本概况和技术发展简介； ? 重测序的基本概念、研究历史、内容和意义； ? 重测序研究策略以及技术、前沿热点及趋势； |
Linux上机操作及生物信息学软件安装 | ? linux基础基本操作； ? 生物信息学软件应用及常用软件介绍、重测序相关分析软件介绍及安装； |
第二天 | 动物、植物、微生物重测序的案例分析应用及分析流程（个体水平） | ? 动物重测序理论与案例分析； ? 植物重测序理论与案例分析； ? 微生物重测序理论与案例分析； |
重测序分析上机练习（以细菌和植物为例） | ? 重测序的分析流程； ? 原始测序数据的质控及过滤； ? 学习bwa，samtools,pindel等工具的使用，进行calling SNP、INDEL、SV，变异注释及功能分析； |
第三天 | 重测序(外显子组测序)在群体遗传学中的应用（群体水平） | ? 群体遗传学理论： ? 进化分析； ? GWAS分析； |
群体水平测序数据分析实例 （上机操作） | ? 混池重测序的进化分析流程； ? 孟德尔疾病的外显子组测序分析流程； ? 低覆盖度重测序与缺失基因型填充（Imputation）分析流程； ? 复杂疾病的重测序GWAS分析流程。 |
（课程内容以实际授课为准)
【报名费用】 注册费：工作人员3000元/人、学生2500元/人（含听课费、资料费、上机费、午餐，请自带笔记本电脑以备上机实践使用），主办方可协助安排入住酒店，住宿费用自理。
【付费方式】 现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称：北京市计算中心 账号：0200151819100023937
开户银行：中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
（汇款信息里 备注上：“生物计算事业部——您的姓名”，个人汇款请备注上单位名称）
如需发票请注明发票抬头，培训结束后统一开具发票（培训费、注册费、会议注册费、技术服务费、信息服务费等），有其他特殊要求请声明。
【报名优惠政策】
1、3.1日前预报名的学员每人可优惠400元，
开课前20天报名的学员每人可减少200元,
开课前10天报名的学员每人可减少100元。
2、2人团报每人可减免200元，3人以上团体报名每人可减少400元；
3、4+1团报，可免费赠送一个名额
4、上面4种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。
5、老学员、老学员介绍的学员均可以再优惠200元。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
【注意事项】
1、 已经成功付款的学员，如在开课前7个工作日前联系主办方撤销席位，可退还100%的注册费用；如在开课前3个工作日内（含3个工作日）要求撤销席位则退还80%的注册费用。
2、 撤销席位后，学员可提交延期申请，可参加当前时间到2013.12.12日期间由北京市计算中心举办的各类培训，费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款，退款期间产生的所有费用由学员本人承担。
报名截止：2014年4月1日
请联系：小张 010-59341771，18618295767，QQ号：2814500767，
邮箱zhangly@bcc.ac.cn
小员 010-59341773，18701529461，邮箱：yuanll@bcc.ac.cn
报名回执表:
培训班类型：（可多选） | □实用生物信息学培训班 □科研论文绘图研习班 □重测序专题研习班 □宏基因组分析专题研讨班 □Perl语言专题班 □转录组专题研习班 |
姓名： | | 性别： | | 民族： | | 职称： | |
身份证号 | |
工作单位： | | 住宿： | 是□；否□ |
研究方向： | | 报名时间： | |
通讯地址： | | 邮编： | |
固定电话： | | 手机： | | E-mail: | |
对课程了解情况 | ☆☆☆☆☆ | 感兴趣的课程： | |
信息渠道: | □中心主页 □邮件宣传（张利英、员丽丽）□海报 □单页 □销售员 □丁香园 □生物论坛 □生物通邮件 □生物360 □朋友推荐 |
发票抬头： | | 发票内容： | |
住宿明细 | 入住时间： 离店时间： | 房间类型 | □大床间 □标准间（和 合住） □拼房（与其他学员拼标准间） |
备注： | |
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确定报名后，请将回执表发到上述联系人邮箱里。如在两日内没有收到回复，请电话联系确认。