中国科学院北京基因组研究所 www.big.cas.cn/
中国科学院北京基因组研究所于2003年11月28日正式批准成立，是中科院生命科学基础研究所。目前研究所的科研、支撑、管理人员共计184人，中科院院士1人，中研院院士1人，研究员15人，其中百人计划7人，现有在读博士、硕士研究生共计197人。
北京基因组研究所在知识创新工程二期承担了973、科技攻关、863、自然科学基金和院知识创新工程等国家和中国科学院的重大科研任务，取得了令人瞩目的成就，如参与完成了国际人类基因组单体型图计划，独立完成了“中国超级杂交水稻基因组计划”、家蚕基因组计划及家鸡基因多态性图谱等一系列重大科学项目，率先在国内完成SARS病毒的基因组测序及诊断试剂研制等。几年来，在国内外高水平学术期刊上共发表SCI论文近二百篇。
2008年，面对基因组学从过去“以大规模测序为目的”向“以大规模测序为手段来解决科学问题”的一个大转型，新一届领导班子对北京基因组研究所的发展方向和组织机构进行了新的定位和部署，明确了北京基因组研究所的研究方向，即“利用高通量测序技术解决重大科学问题”，基因组研究所的发展目标是加强基因组学前沿研究，引领国际、国内基因组学研究潮流。在此目标的驱动下，基因组所目前装备的测序能力包括9台Solid、1台Solexa及2台3730测序仪，拥有计算能力超过10万亿次的计算机集群。两个核心平台，即基因组学生物信息学平台和细胞平台已经初具规模，基因组研究所的重要研究项目--肿瘤基因组的群体遗传机理、水稻基因组学、干细胞等比较基因组学研究、物种分化与进化生物学研究等正在及将要依托这两个平台进行；这些研究正以破竹之势催生和重组生命科学的新科学理念、新研究方法和新技术平台，成为生命科学最具活力的源头生长点和制高点。它们也是生命科学、生物技术和生物医药产业发展的基本动力和保障；是解决人类健康、农业发展、生态环境和新型能源等重大生命科学和技术问题的基本基础和出发点。
由于基因组学的相关学科的大幅发展，我们未来五年的计划在五年前几乎是无法想象的。基因组学对生物医学、农学、药学、环境科学的影响将会极为深远。北京基因组研究所也将在这样一个大背景下发挥更大的作用，争取成为一个世界著名的研究机构并作为国际基因组学的领导者。
研究方向
人类基因组的纵向深入研究
通过参与国际合作，承担部分人类基因组单体型多态性的研究，建立技术平台和研究体系；进一步开展中国人基因组多态性与疾病和健康关系的研究。
基因组的横向拓展
依托于国际合作，对与农、林、牧、环境和海洋等领域的有重要经济价值、在进化中有重要意义的物种基因组进行测序；整理分析第一手原始数据。在基因组信息学的基础上进行系统的比较、进化和功能分析等深入研究，形成新的思想、概念、方法和技术，全面地认识和探索生命的奥秘。
基因组的功能和动态研究
利用基因组测序的资源和原始数据优势，建立相应的基因和蛋白质组表达检测等技术平台，开展基因组的功能和动态研究。
高性能海量基因组信息数据处理系统的建立
这一系统是大规模基因组研究的核心技术组成和可持续发展的基本保障。一些基因组巨大的物种及多物种间比较基因组的海量信息处理，对高性能计算能力及新的计算理论，新的算法，新的软件体系提出了急切、严峻的挑战。解决这一重大的理论和应用问题需要进行多学科交叉结合的联合攻关，它将是生命科学与信息技术高度发展和完美结合的必然产物，也是一个国家科技综合实力的重要标志。