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产品介绍

STR/SSR微卫星分析

微卫星标记（Microsatellite）也称为短串联重复序列（STR）或简单重复序列（SSR），是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。微卫星位点通常通过PCR扩增和电泳检测，并根据片段大小分离等位基因进行分析；扩增后的等位微卫星可以用多种方法检测，1）传统方法采用聚丙烯酰胺凝胶电泳银染的方法适用于前期批量引物筛选；2）利用ABI遗传分析仪对荧光标记的DNA片段进行检测，结合分子量内标进行DNA片段长度计算，使STR分型变得高效快捷，适合大量样本的检测。

  1） SSR/STR分型分析

前期确认阶段：试验样本类型，数量，引物，签订试验合作合同；

试验阶段：DNA提取，PCR扩增，琼脂糖电泳检测，PAGE筛选批量扩增引物和可以进行混合检测的引物，批量PCR，ABI3700xl批量检测（内标为ROX500，Liz-500）。

数据分析：和客户详细沟通，确认分析方案。品种分析，或群体分析。读取01矩阵or片段大小；聚类分析；多样性分析；多态位点数(AP)、多态位点百分率(P)、平均等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei′s基因多样性指数(H)、Shannon′s信息指数(I)、遗传分化度(Gst)等。利用NTSYS进行聚类分析。

2）客户须知：

本公司需要签订技术服务合作合同；

本公司再试验结束后，如没要求，试验样本将统一销毁；

       本公司不接受具有致病性和潜在危险的原始样本，此类样本请您提供样本DNA。