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      琼脂糖凝胶是由β-D-半乳糖和3,6-脱水-L-半乳糖交替结合所形成的线性多聚糖。利用纯化的琼脂糖热溶液冷却时能凝胶化的特点，可较方便地制成珠状物。在凝胶过程中由单独的多糖链先形成双螺旋，然后聚集成胶束，胶束之间形成微孔，其大小取决于胶束的多少，即琼脂糖的浓度。采用不同浓度的琼脂糖溶液，成球后可得到不同孔径的球状凝胶。最终凝胶结构=琼脂糖凝胶结构

     Sepharose是琼脂糖系中最早的产品，为非交联结构，不能高压灭菌，仅用于2～40℃范围，按琼脂糖含量为2%、4%、6%分成2B、4B及6B三种型号，可用于分离核苷酸类化合物。

      当琼脂糖珠体与2,3-二溴丙醇共价交联可得交链琼脂糖SepharoseCL，其热稳定性及物理化学稳定性大大提高，在中性条件下可经120℃消毒并且非特异吸附性小，对应于原母体也分成CL-2B、CL-4B、CL-6B三种型号，它们除用于凝胶过滤外，还广泛用作离子交换剂及亲和吸附剂的母体。

     琼脂糖凝胶4FF、6FF是高度偶联的琼脂糖凝胶，机械性能大大增强，流速快，适合工业制备生产。化学稳定性高，可用多种促溶剂、有机溶剂操作和1-2M NaOH 在位清洗。