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翻译后修饰蛋白组学

来宝网 2025/11/3点击95次

翻译后修饰蛋白组学 (Post-Translational Modification Proteomics,简称 PTM Proteomics) 是蛋白组学的一个子领域,专门研究蛋白翻译后修饰的类型、位置和动态变化。由于翻译后修饰对于蛋白功能、活性、定位和稳定性有着关键的影响,因此,对其进行深入研究对于理解细胞信号传导、蛋白网络交互和疾病发生机制等方面都具有重要意义。

蛋白质翻译后修饰方式鉴定示意图

图1.蛋白质翻译后修饰方式鉴定示意图


翻译后修饰的种类众多,包括磷酸化、乙酰化、泛素化、SUMO化、糖基化、脱酰胺化等。翻译后修饰致力于鉴定和量化这些不同的修饰:

  • 识别和定量分析: 识别蛋白质上的PTM位点,以及这些修饰的丰度变化。

  • 功能研究: 探究特定PTM如何影响蛋白质功能,包括酶活性、相互作用伙伴和亚细胞定位。

  • 调控机制: 理解细胞如何通过PTM来调控复杂的生物过程。

质谱技术,特别是液相色谱串联质谱 (LC-MS/MS),是研究翻译后修饰的主要手段。通过质谱,可以鉴定修饰的具体位置和种类。为了富集特定修饰的蛋白或肽段,经常使用亲和纯化技术,例如抗体沉淀或特定的结合珠。通过标记(例如 SILAC、iTRAQ、TMT)或标记自由(如SWATH、DIA)的方法,可以定量分析修饰在不同条件下的动态变化。大量的数据处理和分析需要专门的生物信息学工具,例如MaxQuant、Skyline和Proteome Discoverer。

1.疾病研究: 例如癌症、神经退行性疾病中的异常PTM。

2.药物发现: 针对特定PTM酶的抑制剂或激活剂的开发。

3.生物标志物开发: 利用特定的PTM模式作为疾病的诊断或预后指标。

4.基础生物学: 理解细胞信号传导、蛋白质折叠和降解等基本生物过程。


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