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抗体从头测序是指在事先不知道DNA或蛋白质序列的情况下推导抗体的氨基酸序列并发现任何相关的翻译后修饰的分析过程。

抗体序列信息对于理解抗原结合的结构基础至关重要，并使抗体能够用作治疗和研究工具。单克隆抗体的测序有助于生物制药和诊断试剂盒的开发。特别是一抗序列分析是抗体开发和人源化抗体药物开发的基础。然而，由于抗体产品的变异和修饰，大多数抗体的序列信息往往不包含在可用的数据库中。从头测序技术采用先进的数据处理算法进行序列分析，与依赖数据库的传统方法相比具有优越的优势。使用从头测序方法可以准确地分析抗体测序，无需数据库搜索。

图1.单克隆抗体的从头测序示意图

在典型的抗体从头测序工作流程中，通常使用一组不同的酶（一次一种或几种的组合）消化抗体，包括最常用的酶：胰蛋白酶和其他几种酶，例如 Glu-C、Asp-N、如果需要，可以在酶消化之前分离抗体的重链和轻链。然后通过 LC-MS/MS 分析消化的肽。最后使用最先进的计算算法进行数据分析，有效推导消化肽的氨基酸序列并组装重叠肽。

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