来宝网 2025/7/3点击123次
蛋白组学测序是一种用于分析蛋白质表达、修饰和相互作用的技术,它通常依赖于质谱技术。为了进行有效的蛋白组学分析,样本的准备必须满足一定的要求。以下是一些常见的蛋白组测序样本要求:
1.样本纯度:
样本中蛋白质的纯度应尽可能高,以减少非目标蛋白质的干扰。可能需要通过离心、过滤、沉淀、洗涤和电泳等方法来清除细胞碎片、脂质、盐类和其他小分子杂质。
2.样本量:
通常要求有足够的蛋白质量,以确保足够的肽段可以被检测和鉴定。具体数量取决于质谱设备的灵敏度和所需的分析深度,可能从微克到毫克不等。
3.样本缓冲:
样本应在适合质谱分析的缓冲溶液中。不兼容的缓冲剂成分,如某些去垢剂、盐或添加剂,可能会干扰质谱分析或损害质谱仪。
4.蛋白质修饰:
如果蛋白质的某些修饰(如磷酸化、糖基化等)是分析的重点,需要使用保护这些修饰的提取和处理方法。
5.稳定性:
蛋白质样本应在分析前保持稳定,避免降解或变性。这可能要求样本在低温下处理和储存,并使用蛋白酶抑制剂。
6.送样信息:
提供详细的样本信息,包括样本的类型、处理方式、期望检测的蛋白质或研究目标等,有助于实验室更好地理解和满足分析需求。
7.包装与运输:
样本应适当包装,并在冰袋或干冰中运输,以避免在运输过程中的退解或变质。
为确保样本符合要求,实验室在样本收集、处理和运输过程中必须遵循严格的标准操作程序(SOPs)。此外,在送样之前,最好与测序服务提供方进行沟通,确认具体的样本要求,以免影响实验结果。

图1.蛋白质测序示意图