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perl语言零基础培训班

来宝网 2013/7/4点击2421次

 生物信息学Perl语言培训

(零基础初级班)

Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选计算机语言之一,具有功能强大,跨平台运行,操作简单高效等特点,且有巨大的第三方代码库CPAN作支持,十分适用于生物信息研究。

北京市计算中心生物计算事业部,针对生物学、医学、农学等背景的且有从事生物信息学研究工作人员的需要,特开设Perl语言零基础初级班

欢迎您报名参加!

主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部

举办地点:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间2013723-26

报名截止2013 723

培训内容及安排

日期

时间

授课题目

授课内容

第一天

09:30-10:00

生物信息学与Perl语言概述

概括介绍生物信息学背景与Perl语言的概念及特点

10:00-10:20

软件安装与运行环境调试

Perl语言解释器、编辑器安装,Perl程序运行测试

10:20-12:00

基本操作与基本概念

DOSUnix命令行操作基本命令;

Perl语言基本变量与操作符

13:30-16:00

基本变量

变量、字符串赋值、基本运算上机练习

第二天

09:30-12:00

基本语法结构

判断结构;循环结构;上机练习

13:30-16:00

数组及应用

数组的概念及用法;上机练习

第三天

09:30-11:00

文件与文件夹操作

文件的读入与输出;文件夹操作;上机练习

11:00-12:00

二维数组与hash表及应用

二维数组概念、关联数组(hash)概念及用法;上机练习

13:30-16:00

常用函数及子程序

常用Perl语言基础函数学习;

子程序概念与应用;上机练习

第四天

09:30-12:00

正则表达式及生物信息学Perl程序实例

Perl特色功能正则表达式学习与应用;生物信息学实例程序学习;上机练习

13:30-16:00

Bioperl简介、CPAN简介、常用生物信息学数据库与软件简介

Bioperl简介与安装;Perl第三方代码库CPAN简介;常用生物信息学数据库简介、数据类型与应用;常用生物信息学软件数据格式及软件应用简介

授课实例

1、生物学数据文件批量的合并、分隔、去冗余等。

2、生物信息序列数据fastqfastagenbank文件等格式转换与批量自动化处理。

3、按个性化实验需求,从生物信息学数据库文件(如genbankEMBL)中批量自动化提取特定数据信息。

4、表格矩阵型数据的行列转换、特定数据信息的自动化过滤与数据筛选等。

5、二代测序原始数据的批量过滤处理,如barcode识别、质量值过滤等。

6、基因、蛋白质序列特定位点的识别,如起始、终止位点、ORFmotifCDS等。

7、生物信息学数据序列特征提取与自动化统计,如GC百分含量、k-mer统计、基因反向互补转换等。

8、生物信息学数据库文件的批量自动化下载与信息提取。(选学)

(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)

13年暑期课程安排

6.16-6.19(已圆满结束)、7.23-26(报名中)8.26-29(未启动报名)、9.22-25(未启动报名)

培训特色

无需任何计算机语言基础

深入简出,内容精要实用

结合生物信息学背景知识与实例讲授

边学边练,个别辅导,力求实效

报名费用  注册费:2800/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。

协办单位 北京标凯科技有限公司

付费方式现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937 

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)

报名优惠政策

1、开课前20天报名的学员每人可减少200元;

23人以上团体报名的学员每人可减少200元;

3、任意两班同时报名可减少300元;

44+1团报,可免费赠送一个名额;

54种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种,适用于所有培训班。

联系咨询

张利英 010-5934177118618295767,邮箱:zhangly@bcc.ac.cn QQ2814500767

员丽丽 010-5934177318701529461,邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

报名回执表

培训班类型(可多选)

□实用生物信息学培训班  □论文发表所需的图表处理实用技能

□生物信息与宏基因组分析专题研讨班    Perl语言专题班

□实用生物信息技术及应用(罗静初教授主讲)□生物医学动画培训

姓名

 

性别

 

民族

 

职称

 

身份证号

 

工作单位

 

住宿

是□ 否□

□合住

研究方向

 

通讯地址

 

邮编

 

固定电话

 

手机

 

E-mail

 

报名种类

A           B           (该选项仅报名生物信息培训班人员填写)

对课程了解情况

☆☆☆☆☆

感兴趣的课程

 

信息渠道

□中心主页 □邮件宣传(张利英、员丽丽)□邮件宣传(李艳、周会奇)邮件宣传(韩海平)□海报 □单页 □销售员  □丁香园  □生物论坛  □生物通邮件、主页  □朋友推荐               

发票抬头

 

发票内容

 

备注

 

                                   

确定报名后,请将回执表发到上述联系人邮箱里。如在两日内没有收到回复,请电话联系确认。

 

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