来宝网 2013/7/4点击2421次
(零基础初级班)
Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选计算机语言之一,具有功能强大,跨平台运行,操作简单高效等特点,且有巨大的第三方代码库CPAN作支持,十分适用于生物信息研究。
北京市计算中心生物计算事业部,针对生物学、医学、农学等背景的且有从事生物信息学研究工作人员的需要,特开设Perl语言零基础初级班。
欢迎您报名参加!
主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部
举办地点:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间:2013年7月23日-26日
报名截止:2013年 7月23日
培训内容及安排:
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日期 |
时间 |
授课题目 |
授课内容 |
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第一天 |
09:30-10:00 |
生物信息学与Perl语言概述 |
概括介绍生物信息学背景与Perl语言的概念及特点 |
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10:00-10:20 |
软件安装与运行环境调试 |
Perl语言解释器、编辑器安装,Perl程序运行测试 |
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10:20-12:00 |
基本操作与基本概念 |
DOS、Unix命令行操作基本命令; Perl语言基本变量与操作符 |
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13:30-16:00 |
基本变量 |
变量、字符串赋值、基本运算上机练习 |
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第二天 |
09:30-12:00 |
基本语法结构 |
判断结构;循环结构;上机练习 |
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13:30-16:00 |
数组及应用 |
数组的概念及用法;上机练习 |
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第三天 |
09:30-11:00 |
文件与文件夹操作 |
文件的读入与输出;文件夹操作;上机练习 |
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11:00-12:00 |
二维数组与hash表及应用 |
二维数组概念、关联数组(hash表)概念及用法;上机练习 |
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13:30-16:00 |
常用函数及子程序 |
常用Perl语言基础函数学习; 子程序概念与应用;上机练习 |
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第四天 |
09:30-12:00 |
正则表达式及生物信息学Perl程序实例 |
Perl特色功能正则表达式学习与应用;生物信息学实例程序学习;上机练习 |
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13:30-16:00 |
Bioperl简介、CPAN简介、常用生物信息学数据库与软件简介 |
Bioperl简介与安装;Perl第三方代码库CPAN简介;常用生物信息学数据库简介、数据类型与应用;常用生物信息学软件数据格式及软件应用简介 |
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授课实例 |
1、生物学数据文件批量的合并、分隔、去冗余等。 2、生物信息序列数据fastq、fasta、genbank文件等格式转换与批量自动化处理。 3、按个性化实验需求,从生物信息学数据库文件(如genbank、EMBL)中批量自动化提取特定数据信息。 4、表格矩阵型数据的行列转换、特定数据信息的自动化过滤与数据筛选等。 5、二代测序原始数据的批量过滤处理,如barcode识别、质量值过滤等。 6、基因、蛋白质序列特定位点的识别,如起始、终止位点、ORF、motif、CDS等。 7、生物信息学数据序列特征提取与自动化统计,如GC百分含量、k-mer统计、基因反向互补转换等。 8、生物信息学数据库文件的批量自动化下载与信息提取。(选学) |
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(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)
【13年暑期课程安排】
6.16-6.19(已圆满结束)、7.23-26(报名中)、8.26-29(未启动报名)、9.22-25(未启动报名)
【培训特色】
无需任何计算机语言基础
深入简出,内容精要实用
结合生物信息学背景知识与实例讲授
边学边练,个别辅导,力求实效
【报名费用】 注册费:2800元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
【协办单位】 北京标凯科技有限公司
【付费方式】 现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心 账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)
【报名优惠政策】
1、开课前20天报名的学员每人可减少200元;
2、3人以上团体报名的学员每人可减少200元;
3、任意两班同时报名可减少300元;
4、4+1团报,可免费赠送一个名额;
5、4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种,适用于所有培训班。
【联系咨询】
张利英 010-59341771,18618295767,邮箱:zhangly@bcc.ac.cn QQ:2814500767
员丽丽 010-59341773,18701529461,邮箱:yuanll@bcc.ac.cn
【报名回执表 】
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培训班类型(可多选) |
□实用生物信息学培训班 □论文发表所需的图表处理实用技能 □生物信息与宏基因组分析专题研讨班 □Perl语言专题班 □实用生物信息技术及应用(罗静初教授主讲)□生物医学动画培训 |
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姓名 |
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性别 |
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民族 |
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职称 |
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身份证号 |
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工作单位 |
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住宿 |
是□ 否□ □合住 |
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研究方向 |
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通讯地址 |
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固定电话 |
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手机 |
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E-mail |
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报名种类 |
A□ B□ (该选项仅报名生物信息培训班人员填写) |
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对课程了解情况 |
☆☆☆☆☆ |
感兴趣的课程 |
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信息渠道 |
□中心主页 □邮件宣传(张利英、员丽丽)□邮件宣传(李艳、周会奇)邮件宣传(韩海平)□海报 □单页 □销售员 □丁香园 □生物论坛 □生物通邮件、主页 □朋友推荐 |
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发票抬头 |
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发票内容 |
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备注 |
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确定报名后,请将回执表发到上述联系人邮箱里。如在两日内没有收到回复,请电话联系确认。