RG108(N-Phthalyl-L-trypto…

RG108 (N-Phthalyl-L-tryptophan) | DNMT 抑制剂

CAS：48208-26-0

纯度：99.85%

分子量：334.33

分子式：C₁₉H₁₄N₂O₄

运输条件：Room temperature in continental US; may vary elsewhere.

存储方式：

产品活性：RG108 (N-Phthalyl-L-tryptophan) 是一种非核苷的 DNA 甲基转移酶 (DNMTs) 抑制剂 (IC₅₀=115 nM)，RG108 (N-Phthalyl-L-tryptophan) 阻断 DNA 甲基转移酶的活性位点。RG108 (N-Phthalyl-L-tryptophan) 引起抑癌基因的去甲基化和再激活，但不影响着丝粒卫星序列的甲基化。

生物活性：RG108 (N-Phthalyl-L-tryptophan) is a non-nucleoside DNA methyltransferases (DNMTs) inhibitor (IC₅₀=115 nM) that blocks the DNMTs active site. RG108 (N-Phthalyl-L-tryptophan) causes demethylation and reactivation of tumor suppressor genes, but it does not affect the methylation of centromeric satellite sequences^[1][2][3].

体外：RG108 在体外阻断 DNA 甲基转移酶，并且不会在人类细胞系中引起共价酶捕获。用低微摩尔浓度的 RG108 孵育细胞会导致基因组 DNA 显著去甲基化，而没有任何可检测到的毒性。有趣的是，RG108 引起肿瘤抑制基因的去甲基化和再激活，但它不影响着丝粒卫星序列的甲基化^[1]。在另一项研究中，研究了生物素化 RG108 偶联物的合成和体外分析，以评估与 DNA 甲基转移酶的相互作用^[2]。近期的一项研究表明，与天然 SMs 相比，RG108 可以显著降低 SM 衍生的 iPS 细胞中的 DNA 甲基转移酶活性^[3]。

激酶试验：体外甲基化实验的底物DNA是来自人类p16Ink4a基因启动子区域的798 bp片段(相对于起始密码子为- 423/+375)。甲基化反应中含有350 ~ 400 ng底物DNA和4个单位的m.s sssi甲基化酶(0.5 μM)，终体积为50 μL。抑制剂的浓度分别为10 μM、100 μM、200 μM和500 μM。反应在37℃下进行2小时。反应完成后，65℃灭活15分钟，用PCR纯化试剂盒纯化DNA。用30单位BstUI在60°C下消化300纳克纯化的DNA 3小时，并在2%三硼酸EDTA琼脂糖凝胶上分析。

参考文献：

[1]. Brueckner B, et al. Epigenetic reactivation of tumor suppressor genes by a novel small-molecule inhibitor of human DNA methyltransferases. Cancer Res. 2005 Jul 15;65(14):6305-11.    

[2]. Schirrmacher E, et al. Synthesis and in vitro evaluation of biotinylated RG108: a high affinity compound for studying binding interactions with human DNA methyltransferases. Bioconjug Chem. 2006 Mar-Apr;17(2):261-6.  

[3]. Pasha Z, et al. Efficient non-viral reprogramming of myoblasts to stemness with a single small molecule to generate cardiac progenitor cells. PLoS One. 2011;6(8):e23667.