根系是植物与土壤进行物质循环和能量交流的重要界面，了解根系构型，或根系随时间变化的三维结构，已成为当前研究的主要热点之一。深入准确地连续测量和分析植物根系生长特征及其参数，对于深入了解根系生理过程和生态功能等具有重要意义。植物根系图像分析仪通过扫描洗净后的根系获取图像，然后进行图像识别分析，可测量计算出根系长度、直径、面积、体积、根尖等基本的形态学参数。利用软件的色彩等级分析功能，还可以对根系颜色进行分析，从而进行根系存活数量、根系生长和营养状况等方面研究。托普云农植物根系图像分析仪也叫根系扫描仪，可对批量的根系图像进行一键分析，设有辅助测量功能，支持手动修正。以下是该仪器的详细介绍：
功能特点
1.图片预处理功能
1.1二值化：在目标和背景比较相似时，调整阈值来凸显目标轮廓。
1.2杂质剔除：设定一个像素值后，软件自动剔除图片中小于该像素的独立点，以保证分析不受杂质影响，更为准确。
1.3自由选择目标区：分析根系的某一部分。
2.辅助测量功能
2.1放大缩小：放大缩小图片以便对根系局部进行观察和调整。
2.2自动标定：用户输入扫描像素后，软件自动换算实际长度。
3.保存图片、数据导出及追加
3.1保存图片、数据导出：将图片或数据导出至指定文件夹。
3.2数据追加：将该条数据追加至指定文件下方。
3.3直方图导出：根据分档参数不同，导出相应的直方图。
4.各个参数的自定义分档
长度、直径、投影面积、表面积、体积均可进行自定义分档，分档结果可导出。
5.大批量全自动分析：
打开多张图片后，自动进行分析，并显示分析进度，分析完成后自动导出至固定文件夹。
6.拓扑分析
选点后自动识别后用不同颜色标出主根及侧根、自动计算侧根数量。
7.还原至初始图片：
在图片进行分析或操作后，将图片还原为刚打开时的状态。
8.手工校正分析结果：
合并分叉、删除连接、合并根尖、断开连接、毛刺去除