Hieff? Fast T4 DNA Ligase (400 U/μL)
产品信息
产品名称 | 产品编号 | 规格 | 价格(元) |
Hieff? Fast T4 DNA Ligase (400 U/μL) | 10299ES40 | 40000 U | 983.00 |
产品描述
Hieff? Fast T4 DNA Ligase是一款可用于NGS建库过程中DNA片段和接头连接的单酶产品,该产品已经过高通量测序验证,质量优异。本酶具有高效的连接能力,非常适合复杂结构核酸片段的连接,比如华大平台的Ω接头。对于无需进行体系调整的客户,推荐选购Hieff NGS? Ultima DNA Ligation Module (Cat#12604),其核心组分即为本品。
产品组分
组分编号 | 组分名称 | 规格 |
10299-A | Hieff? Fast T4 DNA Ligase (400 U/μL) | 100 μL |
10299-B | 10 × T4 DNA Ligase Buffer | 250 μL |
运输和保存方法
冰袋运输。-20℃保存,有效期2年。
单位定义
在20 μL的连接反应体系中,6 μg的λDNA-Hind Ⅲ分解物在16℃下反应30 min时,催化50%以上的DNA片段发生连接所需要的酶量定义为1个活性单位(U)。
质量控制
核酸外切酶残留检测:2000 U的本品和0.6 μg λ-Hind Ⅲ在37℃下反应4小时,DNA的电泳谱带不发生变化。
核酸内切酶残留检测:2000 U的本品和0.6 μg Supercoiled pBR322 DNA在37℃下反应4小时,DNA电泳谱带不发生变化。
注意事项
1)Buffer在融解时,如果出现少量沉淀属正常现象,请颠倒混匀后使用。
2)为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
使用方法
1. 目前主流的合并法DNA建库试剂盒,其末端修复和加A处理后一般不纯化,直接进行接头连接。本试剂盒可与主流的商业化末端修复加A体系兼容,进行接头连接。反应体系请参考如下配制,涡旋瞬离后置于20℃,反应15 min即可。
表1 Adapter Ligation体系
名称 | 体积(μL) |
dA-tailed DNA | 60 |
10 × T4 DNA Ligase Buffer | 10 |
50% PEG 6000 | 10* |
DNA Adapter | X** |
Hieff? Fast T4 DNA Ligase | 1-5*** |
ddH2O | To 100 |
【注】:*试剂盒内未提供50% PEG 6000,需自行准备。
**接头用量参考表2。
***Hieff? Fast T4 DNA Ligase用量可根据需要添加1-5 μL。
2. Adapter的质量和使用浓度直接影响连接效率及文库产量。Adapter用量过高可能会产生较多Adapter Dimer;用量较低可能会影响连接效率及文库产量。表2列举了使用本试剂盒,不同Input DNA量推荐的Adapter使用量。
表2 500 pg-1 μg Input DNA推荐的Adapter使用浓度
Input DNA | Adapter : Input DNA摩尔比 | Input DNA | Adapter : Input DNA摩尔比 |
1 μg | 10:1 | 50 ng | 100:1 |
500 ng | 20:1 | 25 ng | 200:1 |
250 ng | 40:1 | 1 ng | 200:1 |
100 ng | 100:1 | 500 pg | 400:1 |
【注】:Input DNA摩尔数(pmol)≈ Input DNA质量(ng)/ [0.66 × Input DNA平均长度(bp)]。
【接头添加计算举例】:当Input DNA为100 ng,Input DNA长度为300 bp时,接头应该添加多少?
第一步,计算Input DNA摩尔数。公式:Input DNA摩尔数(pmol)≈ Input DNA质量(ng)/ [0.66 × Input DNA平均长度(bp)];
Input DNA摩尔数(pmol)=100 ÷(0.66×300)=0.5 pmol;
第二步,计算接头添加摩尔数。根据表2查询接头添加比例;
根据表2,查得Input DNA 100ng时接头添加比例100:1,则接头添加摩尔数=100×0.5 pmol=50 pmol;
第三步,计算接头添加体积。接头浓度=15 μmol/L(如使用其他接头,浓度需要依据其他接头浓度参数);
接头添加体积=接头添加摩尔数(50 pmol)÷接头浓度(15 μmol/L)=3.34 μL(注:15 μmol/L=15 pmol/μL)
综上,接头可添加3.4 μL。(注:接头最大加入体积不超过5 μL)
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