细胞STR分型介绍
细胞STR分型(cell line STR genotyping)也称为短串联重复序列(short tandem repeat,STR)分型、简单重复序列(SSR)分型或微卫星标记(Microsatellite)分型,是检测广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。一般由2-6bp的核心序列串联重复而成,构成了STR基因座的遗传多态性。对于一个特定的个体,染色体上某个特定位置的重复序列的重复次数是固定的,而对于不同的个体重复次数可能不同,这就构成了人群中STR的多态性。由于人类基因组中这种重复序列非常多,通过对STR多态性的检测,就可以区分个体之间的差异,确定亲缘关系。
STR/SSR具有分布广泛均匀、多态性丰富、遵循孟德尔共显性遗传、信息量大、检测简便等优点,STR/SSR分型高效快捷,结果准确,是非常重要的遗传标记,在遗传制图、连锁性分析、亲子鉴定、疾病基因定位和物种多态性研究等领域有着广泛的应用。
微卫星位点通常通过PCR扩增,扩增产物通过电泳分析检测。ABI3730XL遗传分析仪对荧光标记DNA片段进行检测,加上分子量内标进行DNA片段长度计算,使STR分型变得高效快捷,结果也更加精确可靠,可以实现包括单倍型分析、遗传连锁分析或构建遗传连锁图谱等在内的多种应用。
检测内容
编号 | 服务名称 | 内容说明 | 周 期 |
MG301 | 微卫星 单色检测 | 单色检测,数据分析至size等 | 5工作日 |
MG302 | 微卫星 多单色检测 | 多色检测,数据分析至size等 | 5工作日 |
MG303 | 微卫星 AFLP跑板 | 上机检测,数据分析至01矩阵等 | 5工作日 |
MG304 | 微卫星 STR跑板 | 上机检测,不分析数据等 | 5工作日 |
MG305 | 微卫星 普通引物合成 | 20D,PAGE纯化,不超过30碱基 | 5工作日 |
MG306 | 微卫星 荧光引物合成 | FAM 2OD HEX 20D TMR 2OD ROX 2OD | 7工作日 |
MG307 | 微卫星 引物设计 | 不含验证 | 3工作日 |
检测流程
技术优势
1. 开发SSR多态性引物
针对基因组序列信息未知或不完整的物种,开发出多态性比较好的SSR引物。
1) 序列已知:根据数据库发布的全基因组序列或EST序列,得到微卫星序列信息。
2) 序列未知:采用磁珠富集的方法,对微卫星序列进行富集、克隆、测序,得到微卫星序列信息。
2. 大量群体样本微卫星分析
针对已开发出的多态性SSR位点,对大量群体样本进行微卫星分析,得到个体的基因型。
3. 根据个体的基因型进行连锁分析
1) 遗传连锁图谱。
2) 连锁不平衡分析。
3) LOH分析。
检测结果示例
我们的优势
1、提供各种实验材料和仪器,满足项目课题实验需要。
2、专业的操作人员。
3、高规格实验室。
4、数据结果交付周期快。
5、完善的服务体系,全程跟进,确保满意。
服务流程
1、提交项目课题相关需求和资料。
2、与我们的专业技术团队讨论项目细节。
3、根据讨论后的意见对实验方案进行修改。
4、双方均满意并达成一致,签订技术服务合同。
5、开展实验,按期完成合同规定的内容。
6、结题,提供实验原始结果和分析结果、实验流程、实验条件等等。