探针捕获技术
探针捕获测序是常用的目标区域基因检测方案,该方案基于多因素算法对目标区域基因组进行设计,然后合成出有效的特异性探针, 进而与基因组DNA进行杂交,将目标区域序列进行捕获并富集后,使用主流的illumina测序平台进行高通量测序。 通过对大量样本的目标区域研究,有助于发现和验证疾病相关的目标基因和关键位点,在临床诊断和药物开发方面有着巨大的应用空间, 同时在农业领域相关研究中也有巨大的应用潜力。
液相捕获
操作简单,对仪器设备要求低,可在几个小时内完成目标序列富集和测序文库构建,特别适用于临床检测。
固相捕获
捕获探针定制化流程
捕获探针性能指标
Sample | Aligned(%) | Initial bases on target | Coverage of target region | Fraction of effective bases on target | Average sequencing depth on target | Fraction of target covered with at least 10X | Fraction of target covered with at least 20X |
1 | 98.8 | 483292 | 100.00% | 40.10% | 237.32 | 100.00% | 99.80% |
2 | 99.4 | 483292 | 100.00% | 40.10% | 219.48 | 100.00% | 99.70% |
3 | 98.81 | 483292 | 100.00% | 40.10% | 202.02 | 99.99% | 99.70% |
4 | 98.85 | 483292 | 100.00% | 40.10% | 237.56 | 99.99% | 99.70% |
5 | 98.4 | 483292 | 100.00% | 40.10% | 230.67 | 99.99% | 99.70% |
送检样本要求
样品类型 | 样品规格 | 样品采集/运输 |
---|
DNA(新鲜/冰冻样品) | >1.0μg,浓度>20ng/μl | 干冰运输 |
血液(全血) | >1ml | EDTA抗凝,2-8 °C冷藏运输 |
新鲜组织 | >500mg | 低于-20 °C(干冰)冷冻运输 |
唾液 | >1ml | 唾液保存液混合可室温运输,直接收集唾液需冷冻运输 |
ctDNA | >1ml | 要求血浆,干冰运输 |
FFPE | >1.5μ,浓度>20ng/μl | 干冰运输 |
细胞 | >8×106 | 去除培养液,PBS清洗1次后液氮速冻,干冰运输 |
石蜡切片 | >5片 | 10×10mm面积,常温运输,穿刺组织>10片 |
石蜡包埋块 | >1块 | 不小于1×1×1mm常温运输 |
单细胞 | >8×106 | 液氮速冻,干冰运输 |
我们的优势
1、极佳的特异性。
2、优秀的覆盖率和均一性。
3、卓越的重现性:重复试验间的差异率不到10E-5。
4、可以精确地检测SNP等常见突变类型。
5、捕获效率高。
服务流程
1、提交项目课题相关需求和资料。
2、与我们的专业技术团队讨论项目细节。
3、根据讨论后的意见对实验方案进行修改。
4、双方均满意并达成一致,签订技术服务合同。
5、开展实验,按期完成合同规定的内容。
6、结题,提供实验原始结果和分析结果、实验流程、实验条件等等。