raybiotech AAH-GF-G1芯片操作流程
(参见英文protocol)
1.实验材料及试剂
1.1 AAH-GF- G1试剂盒,试剂盒包含内容:
? 玻片芯片---(RayBio? Human Growth Factor G1 Microarray slides (1个玻片上有4个或者8个阵列)
? 生物素标记抗体---(Biotin-Conjugated Anti-cytokines,4个阵列配1管,8个阵列配2管)
? 1500×荧光标记链霉亲和素-----(Cy3 equivalent,1管)
? 1X封闭缓冲液---(Blocking Buffer, 30ml)
? 20X的洗液I ---(20X Wash Buffer I,30 ml)
? 20X 的洗液II---(20X Wash Buffer II, 30 ml)
? 2X细胞裂解液---(2X Cell Lysis Buffer,10ml)
? 玻片芯片配件--(玻片框架、垫圈、搭扣边、密封条)
? 30ml管---(tube)
? 操作手册
1.2 所需除试剂盒以外的材料及仪器:
? 塑料离心管(2-5ml,50ml)
? 摇床
? 塑料保鲜膜
? 双蒸馏水
? Genepix荧光扫描仪
? Thermo Scientific Wellwash Versa芯片洗板机
1.3 样品:
8个细胞上清
2 、实验步骤
2.1 玻片芯片的完全干燥
将玻片芯片从盒子中取出来,在室温平衡20-30min后,将包装袋打开,揭开密封条,然后将芯片放在真空干燥器或者室温干燥1-2小时。
2.2 封闭和孵育
1 每个芯片孔中加入100μL的1×封闭液,室温摇床上孵育30min,避免产生气泡;
2抽去封闭液,每个孔中添加100μL样品(原液),一个阵列一个样品;(4 ℃振荡过夜孵育。样品离心13000rpm,8min)
3 使用Thermo Scientific Wellwash Versa芯片洗板机清洗玻片,分为两步,首先用1×洗液I进行清洗,每孔250μL的1×洗液I,清洗6次,每次震荡10s,震荡强度选择高,用去离子水稀释20×洗液I。然后换用1×洗液II通道进行清洗,每孔250μL的1×洗液II,清洗5次,每次震荡10s,震荡强度选择高,用去离子水稀释20×洗液II。
4配制生物素标记抗体,快速离心生物素标记抗体的小管,每个小管加入300μL的1×封闭液,混合均匀。每孔加入70μL生物素标记抗体;
5清洗,同步骤3).
6 每孔加入70μL的1500倍稀释的荧光剂-链霉亲和素 (快速离心后加入1.5mL的封闭液到荧光剂-链霉亲和素的小管),用密封条贴住玻片,然后用铝箔纸包住玻片避光室温震荡孵育1-2个小时。(此步也可在4℃过夜孵育)
7 清洗,同步骤3).
2.3 荧光检测
采用激光扫描仪例如Axon GenePix扫描信号, 采用Cy3或者绿色通道(激发频率=532nm)
1) 扫描仪器: GenePix 4000B Microarray Scanner
2) 产地:MoLecμLar Devices, LLC;1311 OrLeans Drive SunnyvaLe, CA 94089-1136 United States
3) 扫描参数:PMT: 650, WaveLengh:532nm; resoLution:10um
采用芯片分析软件提取数据,采用AAH-GF-G1的数据分析软件来进行数据分析。
实验注意事项
A 玻片的操作
1) 不能触摸玻片的表面,因为玻片芯片非常灵敏,只能接触玻片的边缘;
2) 操作实验时候,请戴上橡胶手套(不掉粉末),以免污染试剂和玻片;
3) 避免打碎玻片
4) 保持实验操作环境整洁;
B 孵育
1) 样品和试剂孵育过程中,保证完全覆盖住玻片,且不能使玻片干燥
2) 孵育过程中避免产生气泡
3) 孵育过程和清洗过程保持在摇床上轻摇
4) 在孵育过程中,用密封条将玻片芯片封闭,尤其是当孵育时间超过2个小时,或者样品、试剂的体积小于70μL的时候。
5) 避免附近孔的交叉污染,邻近孔的液体避免溢出污染。
6) 封闭、样品孵育、检测抗体孵育、Cy3-链霉亲和素孵育都可以在4℃孵育过夜,但是请务必封闭玻片芯片非常严密,以免液体蒸发;