ceRNA芯片（circRNA/lncRNA/mRNA三合一表达谱芯片）
一、背景介绍：
环状RNA（circRNA）是mRNA在剪接的过程中，上游exon的5’端与下游exon的3’端剪接到一起，从而形成的首尾相接的环状RNA分子。 近来的研究表明，高等动物中环状RNA的种类和含量远远超过预 期。 最近的研究发现circular RNA可以作为“microRNA海绵”，竞争结合microRNA从而解除这些microRNA对其他靶标的调控；同时保守型分析发现环状RNA上潜在 具有多种RNA结合蛋白的结合位点，暗示circular RNA可以调控RNA结合蛋白的功能。更为重要的是，circular RNA的表达呈现出很强的组织特异性，暗示这些circular RNA具有重要的生物学功能。但目前对circular RNA的研究刚刚起步，这类RNA的生物学功能还有待挖掘，因此是一个值得深入的研究方向。
鼎赛基因为适应最新科研热潮，以便更好地为科研工作者服务，特推出了ceRNA芯片（circRNA/lncRNA/mRNA三合一芯片）。
二、芯片特点：
芯片覆盖circRNA、lncRNA、mRNA。一份芯片数据同时提供三个层面的表达信息，circRNA和lncRNA作为典型的内源竞争性RNA，此款芯片可以让您畅游ceRNA调控研究。circRNA所有探针设计基于最新最全的国际主流circRNA数据库信息。环状RNA -特异的反向剪接位点探针设计，保证每个探针检测的特异性，避免与母基因之间的冗余影响。lncRNA及mRNA-探针设计基于最新基因组版本（human/GRCh38(hg38)），涵盖GENCODE V21、Ensembl 、UCSC、NONCODE、LNCipedia、lncRNAdb等核心lncRNA数据库；生物信息专家对来自上述数据库的全部lncRNA序列进行序列比对，去冗余，并对精简后的lncRNA序列设计特异探针，尤其对于有部分重叠序列的lncRNA与mRNA 进行了很好的处理。
四、数据库来源：
包含88371个circRNA+77103个lncRNA+18853个mRNA
五、样品要求：
1.样品类型：细胞、全血或新鲜组织或RNA样品。
2.样品总量：细胞样品请提供至少1×106个细胞，组织样品请提供绿豆大小的组织块，全血样本2.5ml，RNA样品请提供5 μg以上的总RNA。
3.样品质量：RNA无明显降解，提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间，浓度 ≥ 500 ng/μl，28S:18S ≥ 1.5，RIN ≥ 7。
4.样品保存：细胞样品加TRIzol保护，新鲜组织块液氮速冻转入-80度或者RNA保存液浸泡后-80度保存，全血样本用PAXgene RNA采血管采集，RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。
5.样品运输：样品置于1.5 ml管中，封口膜封好，干冰运输。
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