lncRNA/mRNA三合一表达谱芯片
一、背景介绍：
长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA) 指的是长度在200-100000 nt之间的RNA分子。它们不编码蛋白，但参与细胞内多种过程调控。人们对lncRNA的认识还处在初级阶段，lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究表明，lncRNA参与了X染色体沉默，基因组印记以及染色质修饰，转录激活，转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，lncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。lncRNA的种类远远超过编码RNA，哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是lncRNA（相应的蛋白编码RNA的比例是1%-5%）。lncRNA已经成为非编码RNA研究领域的一个热点。
lncRNA研究的重要一步是发现与特定疾病相关的lncRNA。传统的lncRNA筛选方法（SELEX等）效率低下，假阳性率高。而基因芯片具有覆盖全面、高效、准确的特点，因此用基因芯片来筛选lncRNA是一种准确快捷的方法。
鼎赛基因针对广大客户的需求，开发出全新的lncRNA/mRNA二合一表达谱芯片，并利用Agilent公司专利的SurePrint技术制造。为您提供完善的基因芯片技术服务，并完成数据分析，提供完整的实验报告。
二、芯片特点：
芯片覆盖lncRNA、mRNA。一份芯片数据同时提供二个层面的表达信息，lncRNA及mRNA-探针设计基于最新基因组版本（human/GRCh38(hg38)），涵盖GENCODE V21、Ensembl 、UCSC、NONCODE、LNCipedia、lncRNAdb等核心lncRNA数据库；生物信息专家对来自上述数据库的全部lncRNA序列进行序列比对，去冗余，并对精简后的lncRNA序列设计特异探针，尤其对于有部分重叠序列的lncRNA与mRNA 进行了很好的处理。
三、芯片内容：
人：18853个mRNA+77103个lncRNA
小鼠：20145个mRNA+58952个lncRNA
大鼠：16623个mRNA+23260个lncRNA
四、样品要求：
1.样品类型：细胞、全血或新鲜组织或RNA样品。
2.样品总量：细胞样品请提供至少1×106个细胞，组织样品请提供绿豆大小的组织块，全血样本2.5ml，RNA样品请提供5 μg以上的总RNA。
3.样品质量：RNA无明显降解，提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间，浓度 ≥ 500 ng/μl，28S:18S ≥ 1.5，RIN ≥ 7。
4.样品保存：细胞样品加TRIzol保护，新鲜组织块液氮速冻转入-80度或者RNA保存液浸泡后-80度保存，全血样本用PAXgene RNA采血管采集，RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。
5.样品运输：样品置于1.5 ml管中，封口膜封好，干冰运输。
天津鼎赛生物基因科技有限公司
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