KAPA文库构建试剂盒提供了便捷的“混合体系”反应缓冲液,包含了除寡聚核苷酸接头和PCR引物之外的所有成分。同样,还含有一个可用于文库构建过程每一步的单酶混合液,减少了移液的次数。
高保真PCR是用于富集带有特异接头序列的文库片段,并且在测序之前扩增DNA。对于文库的PCR富集,保持最小的扩增偏差以确保序列覆盖率是非常重要的。这样就能够由最小的总序列量获得有效的测序,即得到最高的整体覆盖率。
KAPA高保真DNA聚合酶设计用于低偏差、高保真PCR,适用于二代测序文库扩增。这种内在的高合成能力导致产量、灵敏度、速度、模板长度以及对困难模板扩增能力的显著提升。这些性能的提高减少了扩增偏差,扩大了序列的覆盖区域。KAPA文库构建试剂盒还包括了KAPA高保真热启动混合体系(2×),含有除引物和模板之外的所有PCR体系。
产品优势
目前二代测序(Next-Generation Sequencing,NGS)文库构建普遍存在以下问题:
1)扩增产生较大程度的Bias;
2)扩增效率偏低,未覆盖区域偏多。
KAPA NGS文库扩增试剂,采用独特的KAPA HiFi高保真酶体系,大大提高扩增效率,降低扩增Bias和未覆盖区域。保证数据真实可靠的同时,降低反应次数,节省成本。
产品应用
该试剂盒趋向用于Illumina文库(基因组DNA文库、双末端DNA文库、双末端多重DNA文库)的构建,但也可用于其他需要有效的末端修复、加A、加接头和/或文库扩增步骤。
操作流程
1.End Repair:The end repair module produces blunt-ended,5’-phosphorylated
DNA fragments. End Repair Enzyme Mix: (1) T4 DNA Polymerase, DNA PoI, and T4 Polynucleotide Kinase (50μl or 250μl); (2) 10×End Repair Buffer with dNTPs (100μl or 500μl) | |
2.A-Tailing:The A-Tailing module adds dAMP to the 3’-ends of the dsDNA fragments.
A-Tailing Enzyme: Klenow Fragment 3’-5’ exo-(30μl or 150μl) 10×A-Tailing Buffer (50μl or 250μl) | |
3.Adaptor Ligation:The ligation module e ligates dsDNA adaptors with 3’-dTMP overhangs to library fragments
DNA ligase (50μl or 250μl) 5×Ligation Buffer (100μl or 500μl) | |
4.Amplification:
常规PCR扩增 2×KAPA HiFi Hotstart ReadyMix (250μl 或1250μl) | |
Real-Time PCR 扩增
2×KAPA HiFi Hotstart Real-Time PCR Master Mix(250μl 或1250μl)4×Fluorescent Standards(1500μl each) | |
详细操作步骤请见说明书