Phalanx平台,小鼠表达谱芯片 v2 保留 v1 中专一性佳的 MEEBO 探针， 并依据 RefSeq 42 及 Ensembl 59 数据库进行探针的更新， 提供更高基因覆盖率的表达谱芯片。探针设计采用 “一个基因，一个探针” 的设计原理， 以 IMPORT 专利技术针对蛋白质编码基因设计高专一性探针， 并以自主的高速布放技术进行芯片生产。 小鼠表达谱芯片 v2 探针内容
探针种类 探针数
基因探针设计数据库： 26,423
- RefSeq release 42
- Ensembl release 59
控制探针数 872
总探针数 27,295
基因探针
小鼠表达谱芯片 v2 版次除了保留 v1 中专一性佳的 MEEBO 探针外， 更参考国际公认之 RefSeq 42 及 Ensembl 59 序列数据库， 设计长链 60 个碱基寡核酸 (sense-strand) 的基因探针， 内容以蛋白质编码基因 (protein-coding gene) 为主， 提高整体的基因覆盖率外与提供完整的生理途径反应相关的基因， 并且每一个探针对其源数据库的目标基因皆具高度专一性，避免非目标基因的杂交影响。
此外，华联专业团队建构 ”华联探针批注搜索引擎” (PASS) 网站， 方便使用者查询各探针相对应于 NCBI 及 Ensembl 数据库的详细批注。 |