一、BioNumerics生物信息分析软件六大应用模块:
1.Fingerprint types:
处理PFGE, AFLP, RFLP, RAPD, REP-PCR, ARDRA, IEF,DGGE, TGGE等电泳数据;气相色谱和HPLC数据;DHPLC数据; 分光光度曲线等数据。
2.Character types:
处理生物抗性实验数据;脂肪酸甲基化脂(FAME)分析数据;生物显性阵列数据;API表型测试数据;微阵列芯片数据;生化试验数据;酶活和代谢活性数据等。
3.Sequence types:
处理核酸(DNA或RNA)和氨基酸序列;自动测序仪(Applied Biosystems, Beckman, Amersham)得到的色谱文件;可识别各种序列格式, 包括EMBL, GenBank和Fasta格式。
4.Trend data types:
处理实时荧光定量 PCR数据;代谢活性和酶活性的动力学数据;微阵列实验中的时间进程数据等和趋势相关的实验数据。
5. 2D gel types:
处理双向凝胶电泳试验数据;DIGE试验数据。可以将从2-D胶中鉴定到的蛋白点被直接存储在数据库中。
6.Matrix types:
处理DNA同源性相似度的表格数据;DNA杂交数据等矩阵类型数据。
二、BioNumerics生物信息分析软件六大分析模块:
1. Tree and Network Inference:在BioNumerics中通过把关系数据库中的各种记录之间,多种试验之间,用多种聚类算法可以实现多种聚类分析。Bionumerics 6.0 还提供了独特的技术评估聚类分析的可靠性。
2. Identification: 根据生物试验数据结果来鉴定未知的生物体或物种,可构建文库。
3. Molecular Analysis Tools: 开放读码框架分析,预测蛋白序列。限制性酶切分析,引物设计等。
4. Dimensioning techniques: 多维的数据存储,方差分析等生物学数据统计分析。
5. Database Sharing Tools:数据库共享工具。
6. Audit Trailing and Versioning:适用于GLP实验室。