| 专一性 Specificity |
| 部分 miRNA 家族仅有 1 个核苷酸的差异 (如右图的 let-7 family),使得 miRNA 的研究对于专一性的要求远高于其它产品。华联生物科技以合成的 miRNA 进行杂合实验,测试 let-7 family 探针的讯号,下图结果显示有一个核苷酸差异以上的探针讯号仅为正常讯号的10% 左右。 |
|
miRNA
|
Sequence
|
Length (nts)
|
|
let-7a
|
UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU
|
22
|
|
let-7b
|
UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU
|
22
|
|
let-7c
|
UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU
|
22
|
|
let-7d
|
AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU
|
21
|
|
let-7e
|
UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU
|
21
|
|
let-7f
|
UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU
|
22
|
|
let-7g
|
UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU
|
21
|
|
let-7i
|
UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU
|
21
|
|
|
|
| |
| 数据验证 Validation |
| 华联的miRNA 芯片拥有极佳的正确性。二种不同组织的small RNA 以荧光标记后,分别杂合于不同的芯片上,并以liver 为基础计算Kidney / Liver 的比值。同样的RNA 亦进行 real-time qPCR 的实验数据,结果显示华联芯片与real-time qPCR 的相关性达0.927 (Kidney / Liver, 右图)。由于real-time qPCR 只侦测mature miRNA,此结果亦展现华联 miRNA 芯片具有专一辨识mature RNA 的能力。 |
 |
|
| |
| 跨平台可比性Cross-Platform Comparability |
| 将 heart 与 liver 的small RNA 以荧光标记后,分别杂合于不同的芯片上,以liver 为基础计算Heart / Liver 的比值。华联结果(PHX) 与 Agilent 数据(AGI, GEO 数据库的GSE11879) 和Land graf P. 等人的sequencing 资料(CLN, Cell 2007 Jun 29;129(7):1401-14.) 比对,右图为利用hierarchical clustering 运算的结果,显示华联miRNA 芯片与其它二个平台具有良好的一致性。 |
 |
|