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通过检测乳腺癌中调控因子下游基因的表达水平,达特茅斯希区柯克诺里斯的棉花癌症中心(NCCC)的研究人员鉴定出了E2F4中的一种基因标签,可以预测雌激素受体阳性(ER+)的乳腺癌。这项发表于Breast Cancer Research的研究给有“中级复发风险”的乳腺癌女性患者的个性化治疗提供了机会。对于有“中级复发风险”的患者,到目前为止还没有标准的治疗方法。NCCC的结果建议将20-30%的患者的风险等级定为“复发高风险”,这意味着他们需要接受积极的后续治疗。
“我们的数据驱动的方法(针对ER+乳腺癌患者中的E2F4活性,设计一种有效的预后基因组标签),给我们提供了必要的信息来开发一种简单的临床测试,这种测试能帮助医生选择最有效的治疗方案,”该研究的带头人Cheng说。“此外,我们的方法非常灵活,由于E2F4在很多类型的癌症中都必不可少,该方法将有助于解决很多生物医学难题。”
研究的目的是设计一种准确快速的基因组测试来检测E2F4相关的调控因子的活性水平,Cheng的团队通过观察转录因子的异常行为(导致细胞增殖失控的失调的基因表达,肿瘤发生以及转移)来探究和预测所有癌症的根源。
研究人员通过染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)确定了目标基因,他们比较了癌组织中E2F4的调控活性评分(RAS),以确定活性和患者生存力之间的关联。E2F4的预后标签能预测乳腺癌患者的治疗效果,无论治疗现状以及很多其他的临床病理变量状态是怎样的。
Cheng解释了E2F4标签的转化应用,“通过开发灵活可重复的预测测试,我们给工作在很多癌症领域的医生们提供了个性化治疗所需的信息。个性化医药的本质是:在对的时间对对的患者进行对的治疗。”
研究团队下一步的计划包括在其他的乳腺癌数据集中评价E2F4的预后潜力以证实它的广泛的有效性,以及将标签缩减至关键的组分基因以提高标签的性能。