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美国德州大学西南医学中心的癌症研究人员已经证明,我们可以应用全基因组测序识别患者的遗传性癌症风险,可能在癌症患者的预防,诊断,和照料等方面产生改善。
本研究是首次利用全基因组测序,对258名癌症患者的一系列基因进行评估,该研究可以提高诊断癌症促发性突变的能力。研究相关文章发表在EBioMedicine上。
“全基因组测序是一个新的基因工具,可以对一个人的DNA序列进行测序,这是以前从没有过的。我们的研究结果显示,近90%的临床发现,基因突变确实可被发现,我们也发现了癌症基因的额外突变,这种基因组突变与全基因组测序相关,这种方法将提高对病人的护理方式,以及发现新的癌症基因的能力,“ Theodora Ross博士如是说,她是内科医学教授,也是美国德州大学西南医学中心的癌症遗传学计划的主管。
美国德州大学西南医学中心遗传癌症诊所的医生及相关工作人员,可以帮助病人评估许多类型的癌症的风险,包括肾脏、皮肤、肺癌、乳腺癌、卵巢癌、结肠癌、内分泌和前列腺癌等。Ross博士和她的团队建议病人,找到一个已知的癌症基因突变倾向,是发现早期癌症的最好方法,或许也是防止癌症形成的有效办法。
大约10%的癌症是由已知的遗传基因突变引起的。这些细胞内基因的突变通过细胞复制传递下来。BRCA1和BRCA2基因的突变是最常见的引起遗传性乳腺癌的原因。BRCA基因突变与患乳腺癌的风险紧密相关,但它的突变也导致卵巢癌,前列腺癌、胰腺癌、和其他癌症风险的增加。此外,还有许多不同的基因与乳腺癌风险增加相关,包括ATM,CDH1,CHEK2,PALB2,PTEN和TP53等基因,研究人员也在不断研究并力求发现可能影响癌症倾向的其他的基因。
在本研究中,研究人员开发了分析全基因组测序所产生的大量的数据的新方法。具体来说,Ross博士的团队设计了一个方法,即将一组BRCA1或BRCA2基因突变患者和没有BRCA突变的患者进行对比。在BRCA患者组中,所有患者的BRCA1基因或BRCA2基因发生突变,与预期一致的是,已经确定了至少88.6%的变异。相比之下,在没有发生BRCA基因突变体中,不同种类的癌症基因的突变被相继发现。
“结果表明,在非BRCA突变的‘神秘’患者中,全基因组测序可以发现新的癌症基因的突变,显示了全基因组测序带来的未来癌症诊断方面的附加值,”Ross博士说,为了能够精确地解释发现的突变的临床意义,因此还需要进一步的调查。
“神秘的病人指的是那些有癌症家族史的人,但通过标准的基因测试后,没有表现癌症基因遗传现象。在我们的研究中,基因组排序帮助我们发现新的神秘候选癌基因突变患者,”Ross博士说,文章中,她提到Jeanne Ann Plitt教授在乳腺癌中的研究,Isabelle T. Decherd在内科领域的重要研究,也纪念了在医学方面作出巨大贡献的Henry M. Winans博士的贡献。