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有效的肺癌治疗手段的开发一直以来都很具挑战性,部分是由于这种疾病涉及太多的遗传突变。
通过分析肺癌的DNA和RNA,密歇根大学综合癌症中心的研究人员发现,含有大量基因融合的肺癌患者的病情要比含少量基因融合的患者严重。基因融合是遗传异常的一种表现形式,当基因发生重排并融合到一起时可在癌症中检测到这种遗传异常。
另外,研究人员鉴定出了肺癌中的几种新的遗传突变,肺癌患者包括有吸烟史的患者。
“肺癌是一种复杂的疾病,它有很多种诱因。我们通过深度测序分析发现了肺癌中新的基因融合。这些新突变也许能作为新的治疗手段的靶点,”研究的作者Arul Chinnaiyan说,他是密歇根转化病理学中心的主任。
该研究分析了来自吸烟和不吸烟患者的753份肺癌样本。其中的153份样本来自密歇根大学,研究人员将这些样本与来自癌症基因组数据库的521份样本做了比较。
研究人员在每一份肿瘤样本中平均发现了13个融合,共计6348种融合。最常见的突变发生在两条基因通路中:Hippo通路(之前发现它与一些罕见的癌症相关)以及NRG1(在癌症中未见该通路)。
该研究发表于Nature Communications。
研究人员已获悉,三种常见的基因融合(ALK,RET和ROS)在约5%的肺癌中充当一定角色,但是它们主要是在不吸烟的肺癌患者中发生。新的异常仅存在于不含ALK,RET和ROS融合的患者中。
“我们的结果暗示,在基因组更为复杂的吸烟的肺癌患者中,基因融合事件发生频繁,”研究的作者David G. Beer说。
医药公司已经开始测试靶向Hippo通路及NRG1的药物。研究团队建议将这些抑制剂作为潜在的肺癌治疗手段。
此外,他们发现基因融合的数目与预后相关,这意味着可以建立一个能帮助医生确定患者肿瘤恶性程度的筛选平台,以进行个性化治疗。
研究鉴别了很多不同的基因融合,它们构成了肺癌的图谱,大部分融合仅出现在少数的肿瘤样本中。Hippo通路融合在3%的患者中出现,而NRG1融合在4%的患者中出现。研究人员建议在这些分子特性的基础上对肺癌亚型进行扩展。
“我们曾成功地针对具有低发生率的基因融合进行了靶向治疗。通过大规模的基因组分析,我们可以鉴别出更多的肿瘤驱动因素,进而进行更恰当的治疗,”Chinnaiyan说。