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耐药菌基因组测序技术新进展

大药丸  发布于:2014/12/15  阅读量:628  来源:Sciencedaily

根据英国公共卫生部门和东英吉利亚大学最新的研究结果,最新的纳米DNA测序技术可以用于诊断细菌感染,该装置仅相当于一个U盘大小。研究人员通过找出了新型多重耐药菌的耐药机制验证了该技术的有效性,该种耐药菌可以引起伤寒。

 

当前长读取基因序列的设备非常昂贵(大约50万英镑),并且分析过程很复杂,通常只有专业的实验室才有该设备。该研究小组开发的新型分析装置称为MinION,由牛津纳米科技股份有限公司生产。该设备的长序列读取过程不同以往,采用了完全不同的技术,不需最佳成像环节,因此大大降低了设备成本(每台装置预期花费大概为650英镑)。长读取过程对于分析耐药基因非常重要。

 

研究人员成功找出了单体型伤寒杆菌H58的耐药基因,其对多种抗菌素都有耐药性,最近在全球广泛流行,证明了该技术的可行性。他们准确找出了染色体结构中的耐药基因,该结构中具有很多耐药基因,被称为抗菌素耐药岛。MinION仅需要18小时就可以得到和当前设备一样精确的结果。

 

首席研究员Justin O'Grady博士表示:“该技术革新了快速传播的耐药菌感染疾病的分析过程。要是以前的话,同样的分析过程,传统的设备需要数月的时间,因为后续的序列数据分析非常耗时。当拿到分析结果时,对于临床诊断和公共卫生干预政策的制定而言,可能为时已晚。”

 

这是全球首次公开发表,证明了MinION序列分析技术巨大应用前景的研究,可以用于解决重要的复杂生物学问题。不久公共卫生部门以及临床实验室就可以使用该价廉快速分析系统,通过与短读取测序装置配合使用,可以分析细菌基因组全部序列。进一步的改进将极大提高分析效率,无需配合短读取测序装置。

 

MinION测序技术将可以用于确定细菌种类,诊断感染性疾病以及细菌耐药性检查,对临床具有重大意义。该技术将使全球科学家都有使用下一代基因测序设备的能力。

 

该研究发表在杂志Nature Biotechnology上。

 

 

 

 


全部评论(2)

  • 1楼
    2014/12/16 8:52:07晨光_Borneosun

    有没讲述该技术是怎样缩短数据分析的文章?

    [0]
  • 2楼
    2014/12/15 21:39:29danee

    期待啊,其实生物医药行业的商机还是很多的,需要我们慢慢的寻找啊~共勉啊

    [0]

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