过去几年，有关消化道细菌（肠道菌群）的研究确定了它们在我们健康上所扮演的角色。INRA参与的一个国际联盟，已开发了至今为止最全面的微生物基因数据库。该目录以约一千万基因为特色，将成为所有有关肠道菌群研究的参考处。

肠道菌群的研究在过去几年倍增，新测序技术于此功不可没。肠道菌群，科学家冠以‘新器官’之名，由上千万亿细菌组成-十倍于人体内的细胞-直接和免疫系统和脑部产生联系。其扮演在如肥胖和2型糖尿病的慢性病的主角。但是，该领域的研究依靠参考基因数据库（或目录）的使用，其在鉴定微生物基因功能上极其重要。现有的目录少而分散的由有局限性的人和地域原点汇集而成。

INRA的研究员们，为MetaHIT国际联盟的一分子，集结了一个目录的微生物基因，其重整了之前来自欧洲，美洲和中国的目录并加入新序列以增强它。除了是一个不平行的资源，为这目录所做的分析显示其包含了全球群组最广谱的细菌基因收藏-延伸至功能。有了万亿的基因，该新目录呈现了世上最瞩目的人类肠道细菌列阵。

多数的基因（约六百万）只为1%的群组所共享，使之甚为稀有。现今最普遍的基因存有大量的数据，将来的研究将专注在决定这些稀有基因的功能及重要性。

感谢这目录，临床上最显著的基因能被描述，特别是那些和2型糖尿病，肝硬化，心脏病和某些癌症等相关的疾病。这也为肠胃菌群失衡（肠胃生态失调）描绘了更周全的景象，尤其是那些由用药引起的。