关于一种关键的肿瘤抑制蛋白（p53）是如何结合到人基因组上的，能源劳伦斯伯克利国家实验室（伯克利实验室）的科学家们给出了新的细节。像生命中的很多事件一样，他们发现p53所处的环境起了很大作用。

研究人员对“p53结合人癌细胞的基因组”这个事件发生的地点进行了绘制。他们将绘制的地图与之前获得的“正常人细胞系中p53的结合位点”的地图进行了比较。这些结合模式暗示了p53是如何将抑制肿瘤生长的基因网络调动起来的。

他们发现，p53占据了不同类型的DNA序列，其中包括含有很多拷贝的序列以及存在于基因组多个位点的序列。这些序列被称为重复序列，它们的含量占基因组的一半，但是相比基因组中编码基因的非重复序列，对它们的功能还知之甚少。

之前一度以为p53结合重复序列，但是伯克利实验室的科学家们获得了一些新的发现：这种蛋白在癌细胞而非正常细胞中的重复序列处更为富集。尽管实验条件一致，这些细胞系中存在的结合模式是非常不同的。他们总结道，这就是证明“作为对相同压力信号的应答，p53选择性地结合到人类基因组上，这种结合模式取决于细胞环境”的证据，多年来该问题一直备受争议。

这项研究发表于PLOS ONE杂志。

“p53调控特定的基因取决于细胞类型和DNA损伤的类型，这已是共识。但是这种特异性是怎么实现的，以及p53是否选择性地结合于基因组，这些仍存在争议。我们证实，p53的结合确实是选择性的，并且取决于细胞环境，”伯克利实验室生命科学部门的Krassimira Botcheva说。

在此类事件中，细胞环境的作用到底是什么？组成基因组的DNA被组装形成染色质，染色质被进一步压缩成染色体。不同细胞类型的染色质状态也不同。癌症能改变染色质而不影响DNA序列，这种变化被称为表观遗传。新的研究显示，染色质的表观改变可能对p53的功能产生大的影响。

“为了弄清楚p53取决于DNA结合的肿瘤抑制功能，我们应当在动态的，癌症相关的表观变化的环境下研究p53的这些功能，”Botcheva说。

他们的发现是关于p53的最新发现。在过去的35年里，科学家们对这种蛋白如何对抗癌症进行了研究。DNA发生损伤后，p53能引发细胞周期停滞，从而为DNA修复争取更多时间。这种蛋白能促进细胞衰老，如果DNA损伤严重，它也能引发细胞死亡。

这项研究主要关注了p53是如何结合到基因组的非重复序列上的。这个最新的研究建议重复序列也值得关注。

“我们的研究暗示，p53结合重复序列对于保持基因组的稳定非常关键，”Botcheva说。“重复序列对于调动整个p53网络以抑制肿瘤影响重大。”