除了死亡、损伤、迁徙，现在进行的叙利亚战争可以引起传染病的流行。发表在《公共科学图书馆：病原体》（ PLOS Pathogens ）上的简短综述报道在叙利亚和周边国家易感人群中传播的疾病。

来自美国北卡罗来纳大学的Sima Sharara和来自贝鲁特美国大学医学中心的Souha Kanj简短的描述了在叙利亚医疗系统上的冲突造成毁灭性后果，并重点关注该区域病例数量持续增长的脊髓灰质炎、麻疹、皮肤利什曼原虫病，并且这些疾病毋庸置疑的是非区域性、全球性、公共卫生紧急事件。

在过去几年叙利亚预防接种覆盖率在下降。在2013年，报道36例脊髓灰质炎病例，第一例出现在1999年，可能由参加巴基斯坦圣战的战士带入的病毒。由于缺乏氯化消毒而不能提供安全饮用和洗涤水使病毒更容易在叙利亚以及周边国家传播，目前7600叙利亚人感染脊髓灰质炎，伊拉克有一例。

第二个流行的疾病与麻疹的预防接种覆盖率下降有关，麻疹顺利通过叙利亚传播到难民营以及约旦和黎巴嫩的居民区。针对脊髓灰质炎和麻疹的接种运动迅速组织起来，但是现在进行的战争和暴力行动阻碍了这一运动。

皮肤利什曼原虫病是由蚋传播的毁容的寄生虫病，这一疾病在叙利亚存在了几十年，但是最近几年出现了戏剧性的增长并传播到周边国家。黎巴嫩之前并没有蚋，很明显是由叙利亚难民带入的，值得关注的是蚋能否长期存在并持续危害难民和原始居民。

伤寒症、甲肝、脑膜炎、疥疮、虱也危害这一区域易感人群，作者说目前国际社会已经对这一危机短暂回应，并期望协调的、详尽的国际反应。