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加州大学圣克鲁斯基因组学研究所9月30日公布埃博拉基因组来帮助全球研究人员来开发疫苗或者抗血清来应对埃博拉病毒。
由圣克鲁斯的加利福尼亚大学研究者Jim Kent领导的小组过去几周夜以继日的工作,与国际合作者沟通收集最新数据。埃博拉病毒五个片段与马尔堡病病毒两个片段比对。在这些片段中,Kent和其他成员比对了148组单独的基因组,其中102个来自西非。
圣克鲁斯基因组学研究所建立圣克鲁斯埃博拉基因组大门,这个大门与新的埃博拉基因组有关也跟与此有关的科学文章有关。
“埃博拉是我在1997年生物课上认识后最为担心的病毒之一”,Kent说。Kent十四年前参与绘制人类基因组草图。“我们需要英雄的力量来限制埃博拉。制作像埃博拉基因组浏览器这样的信息资源是我们能做的。”
全世界的科学家都可以接触开放基因组浏览器可以比对有哪些改变哪些保持不变。这个浏览器允许药物公司、大学、政府的科学家去研究病毒,帮助他们寻找终止埃博拉流行的途径。
随着美国CDC确诊美国第一例埃博拉病例,埃博拉基因组浏览器也被公布了。
在Kent和他姐妹一个电话之后公布了基因组浏览器。他姐妹是CDC的流行病学家,提到她和工作人员面对升级的危机时很迷茫。加州大学圣克鲁兹分校教授HIV专家Phil Berman也向Kent求助来开发埃博拉疫苗。
Kent请求他的上司David Haussler能否将自己小组转移到埃博拉工作上。Haussler也很热情的回复了,然后他们一起在一周内开发出埃博拉基因组浏览器。
“这个团队的将如此大量的信息组装到一个有序有用的模块里的速度表明我们的团队是很优秀的” Haussler说。
在2000年6月Kent和 Haussler在网上发布了人类基因组草图。两个月后,Kent开发了基因组浏览器,基因组浏览器变成了生物医学科学必要的资源。
11年前相似的情况,加州大学圣克鲁斯分校研究人员开发了SARS病毒浏览器。