CUT&Tag试剂盒：从细胞到文库DNA的过程不到5小时
CUT&Tag试剂盒背景资料：
在体内富集组蛋白或转录因子（TF）复合的DNA，然后进行下一代测序，为研究全基因组蛋白质-DNA相互作用提供了有利的工具。它允许分析与活细胞中的DNA序列结合的特定蛋白质。这种分析要求该方法可靠地鉴定真正的靶蛋白富集区域，特别是从有限的细胞样品中。这些样品可以包括从组织中分离的稀有细胞群、从整个细胞群中分选的特定细胞和原代培养的亚群细胞如胚胎细胞。此外，该方法应确保富集的DNA包含Z小的背景，并且蛋白质-DNA结合区域的作图具有Z小的偏差和高分辨率。长期以来用于实现这一目标的主要方法是染色质免疫沉淀，然后测序（ChIP-Seq）。然而，ChIP的主要限制是它需要1）大量的输入材料，细胞或组织，以产生超过背景噪声的足够强的信号;和2）在初始固定步骤期间交联。有几种先进的方法可用于减少细胞数量或提高分辨率的ChIP-Seq。这些方法包括ChIP-exo、ChIPmentation。ChIP-exo提供了高分辨率的映射，但很耗时，并且需要大量的输入细胞。虽然ChIPmentation使用转座酶和测序兼容衔接子来实现ChIP过程中的连接整合，但它遵循传统的缓慢（2天）ChIP程序，无法实现高分辨率映射。
CUT&Tag试剂盒描述：
EpiNext™ cTIP（CUT& Tag In-Place）测序试剂盒是 从哺乳动物细胞开始成功进行cTIP-Seq所需的一整套试剂。该试剂盒旨在从低输入细胞/染色质中富集蛋白质（组蛋白或强结合转录因子）特异性DNA复合物，并使用Illumina平台（如Illumina Genome Analyzer II、HiSeq和MiSeq系统）制备用于下一代测序的文库。创新的工作原理、优化的方案和试剂盒的组分允许以Z小化的非特异性背景水平捕获靶蛋白/DNA复合物，并快速构建非条形码（单重）和条形码（多重）文库，以便以较小的偏差和高分辨率映射靶蛋白-DNA相互作用区域。
艾美捷CUT&Tag试剂盒特点：
1、高浓缩： 使用独特的核酸切割酶混合物，其具有低序列偏倚，以同时片段化染色质并切割/去除靶蛋白/DNA复合物两端的任何DNA序列，而不影响靶蛋白占据的DNA。因此，可以可靠地鉴定真正的靶蛋白富集区域，并且可以实现高分辨率定位。
2、低投入材料： 稳健的无超声片段化、未结合DNA切割和免疫捕获均在同一单管中进行，并采用珠上连接。该方法允许在细胞和组织中使用，并允许以Z小的样品损失对靶蛋白进行Z大的降解保护。结果，输入细胞量可以少至500个细胞或染色质量可以低至50 ng。
3、原位标记： 在DNA纯化之前，DNA衔接子与染色质的珠上连接（原位）导致DNA片段大小增加，允许纯化与转录因子（TF）结合的非常短的片段（例如：< 70 bp）用于文库构建。
4、Z低背景： 在靶蛋白/DNA复合物的两（2）端原位切割未结合的DNA序列能够使免疫捕获/测序背景Z小化，从而允许使用<1000万个读数进行数据分析。
5、快速、简化的程序： 从细胞到文库DNA的过程不到5小时。
6、非常方便：该试剂盒包含CUT&Tag原位测序每个步骤所需的所有组件，足以用于蛋白质/DNA捕获和捕获的DNA文库制备，从而使cTIP（CUT&Tag In-Place）测序试剂盒Z方便，结果可靠且一致。
CUT&Tag试剂盒检测原理：
EpiNext™ cTIP（CUT&Tag In-Place）测序试剂盒包含了从哺乳动物细胞开始进行成功的cTIP-Seq所需的所有必要试剂。在反应中，从细胞中分离出细胞核。目标蛋白-DNA复合物与感兴趣的ChIP级抗体结合/捕获。使用独特的核酸切割酶混合液，染色质被碎片化，目标蛋白/DNA复合物两端的DNA序列被切割/移除。在此过程中，被目标蛋白占据的DNA序列不受影响。接头被连接到珠子上与目标蛋白结合的DNA片段。然后，连接的DNA被释放、纯化，并使用高保真PCR混合液进行扩增，以构建文库DNA。DNA随后被清洁、释放和洗脱。试剂盒中包括一个阳性对照抗体（抗H3K9me3）、一个阴性对照非免疫IgG和对照染色质，这些可以用来在PCR/生物分析仪步骤中展示试剂盒的效果和性能。
使用EpiNext™cTIP（CUT和Tag In Place）测序试剂盒对文库片段的大小分布：用对照抗体（H3K9me3）从Hela细胞分离的500 ng染色质中捕获组蛋白/DNA复合物，并用于DNA文库制备。295 bps的峰值反映了单核小体的插入大小（约150 bps）
https://www.amyjet.com/products/P-2032-12.shtml
——————————————————
CUT&RUN丨染色质分析高效工具：CUT&RUN RNA m6A-Seq
CUT&RUN：
染色质免疫沉淀 (ChIP) 和 ChIP-seq 等能够比对蛋白-DNA 相互作用的方法的开发，使得人们越来越了解到异常的表观遗传调节可以引起许多人类疾病。核酸酶靶向切割和释放 (CUT&RUN) 是一项可用于染色质分析的新技术。
CUT&RUN 是一种使用靶标特异性一抗和Protein A - Protein G - 微球菌核酸酶 (pAG-MNase) 分离特异性蛋白-DNA 复合体的体内方法[1, 2, 3]。从细胞到 DNA 只需 1 至 2 天，并且它可以自动化，实现Z大通量和可重复性[4]。
为了分离目标蛋白-DNA 复合体，首先收集细胞，然后让其结合 Concanavalin A 包被的磁珠，以方便细胞处理，并在后续清洗过程中Z大程度减少细胞丢失。细胞膜用洋地黄皂苷透化，便于一抗进入胞核，在胞核，一抗会结合组蛋白、转录因子或目标辅因子。pAG-MNase 融合蛋白的 pAG 结构域随后结合一抗重链，从而使酶靶向至目标染色质区域。添加 Ca2+ 可激活 pAG-MNase，以启动 DNA 消化。这会使被切割的染色质复合体从基因组染色质中扩散出来、脱离胞核并进入样品上清液，使用 DNA 离心柱或苯酚/氯仿提取后再行乙醇沉淀的方法便可从上清液中收集这些被切割的染色质复合体。
纯化、富集的 DNA 随后使用 qPCR 检测和定量，或用下一代测序分析 (NGS) 与全基因组比对构建DNA 测序文库。
艾美捷CUT&RUN RNA m6A-Seq试剂盒（P-9016）检测原理：
EpiNext™ CUT&RUN RNA m6A-Seq试剂盒包含了从总RNA开始进行成功的m6A-Seq所需的所有必要试剂。在反应中，目标m6A含有区域两端的RNA序列被切割/移除，并且使用结合有m6A捕获抗体的珠子捕获目标m6A含有片段。然后，目标m6A含有的RNA片段被回收、释放、逆转录，并连接接头。连接后的第一条链cDNA被扩增，然后用作文库合成的模板。使用高保真PCR混合液进行文库cDNA的扩增和索引。然后使用结合珠子清理cDNA。试剂盒中还包括一个阴性对照非免疫IgG，可以用来展示试剂盒的效果，并在富集RNA定量或生物分析仪分析步骤中展示性能。
库片段的大小分布。用抗m6A抗体（EpigenTek，#A-1801）从3 ug总RNA中富集m6A片段，并用于DNA文库制备。195 bps的峰值反映了m6A抗体结合的RNA的插入大小（约55 bps）。
CUT&RUN相关文献：
1. Skene PJ, et al. Targeted in situ genome-wide profiling with high efficiency for low cell numbers. (2018) Nat. Protoc 13(5), 1006-1019. Pubmed29651053
2. Meers MP, et al. Improved CUT&RUN chromatin profiling and analysis tools.(2019) BioRxiv 1, 569129. bioRxiv 569129
3. Skene PJ and Henikoff S. An efficient targeted nuclease strategy for high-resolution mapping of DNA binding sites. (2017) Elife 6, e21865. Pubmed28079019
4. Janssens DH, et al. (2018) Epigenetics Chromatin 22(1), 74. Pubmed30577869
https://www.amyjet.com/products/P-9016-12.shtml
——————————————————
PROGEN-AAV衣壳滴度测定：易用、快速、可重复性
重组腺相关病毒（rAAV）载体越来越多地用于体内基因转移，以靶向遗传性疾病。然而，必须对rAAV衣壳滴度进行可靠的定量，以确保将基因安全转移到靶细胞。
您可以依靠PROGEN的AAV ELISA来始终如一地提供可靠的衣壳滴度测定。您可以从AAV滴定ELISA和Xpress ELISA的组合中选择常用的AAV血清型。这些是基于PROGEN-D有的AAV颗粒抗体组合。
艾美捷PROGEN-AAV ELISA优势：
易用性：所有检测都采用类似的工作流程，适用于所有AAV血清型，且无需昂贵设备或特殊培训。包括可单独用于不同测试运行的单次断裂条。
快速：酶联免疫吸附试验(ELISA)试剂盒准备就绪，易于实施到所有工作流程中。Xpress ELISA试剂盒在不到2小时内生成结果，且不牺牲性能。
可靠性：PROGEN独有的颗粒抗体能识别原生的、未变性的AAV衣壳（完整和空壳），用于定量检测完整的AAV颗粒。这是临床试验中已建立成功的行业黄金标准。
可重复性：一种已建立且稳健的方法，能够生成可重复的数据（见图1）。常规AAV ELISA用户可以轻松实现低的试验间和试验内变异，变异系数(CV)低于10%。
准确性：AAV2和AAV8 ELISA基于ATCC国际参考标准物质，所有其他ELISA（AAV1、3、5、6、9和rh10）遵循内部黄金标准。
GMP准备就绪：可验证用于GMP环境，并遵循FDA关于AAV基因疗法开发的指导方针。
PROGEN-AAV Xpress ELISA：不到2小时的结果
AAV Xpress ELISA是为了满足全行业对更快获得结果和节省时间的日益增长的需求而创建的。试剂盒组件已调整，可将检测时间缩短50%以上。Xpress ELISA试剂盒是基于标准PROGEN ELISA试剂盒开发的，因此它们具有相同的准确性和可重复性。区别是，您将能够在更短的时间内处理更多的样本。
Progen提供各种抗体用于鉴别AAV感染的不同阶段以及rAAV的组装分析。艾美捷科技是PROGEN的经销商，为科研工作者提供优质的产品与服务。
https://www.amyjet.com/news/PROGEN-new.shtml
——————————————————
PROGEN-用于病毒定量的简单PlexTM检测方案
随着基因治疗界的时间压力越来越大，找到一种快速且可重复的病毒衣壳测量解决方案至关重要。这就是为什么PROGEN和ProteinSimple联手将我们可靠的AAV颗粒抗体与ProteinSimple自动免疫测定系统的便捷工作流程和鲁棒性相结合的原因。
艾美捷PROGEN-PlexTM检测特点：
专门在生物工艺样品中检测完整的AAV衣壳
在广阔的动态范围内测量病毒滴度
对AAV衣壳的病毒滴度进行定量
使用Ella平台时实现无需手动操作的自动化
您的简单Plex检测优势：
可靠性：
Simple Plex AAV检测试剂盒适用于AAV1、AAV2、AAV6和AAV8。所有检测试剂盒都是基于我们已建立的PROGEN ELISA技术，使用AAV颗粒抗体，专门检测完全组装的AAV衣壳。
快速性：
使用Biotechne Ella平台的自动化过程减少了手动操作时间，同时保持了传统PROGEN ELISA的准确性和效率。
可重复性：
工厂校准的微流体芯片与自动化过程相结合，减少了用户依赖变量以及处理时间。
准确性：
结合易于使用的Ella系统和PROGEN AAV ELISA组件的验证特异性，确保了高准确性以及低的试验间和试验内变异性。
易用性：
Simple Plex AAV检测试剂盒是自动化的，微流体芯片是预先装载的，允许您轻松地将其实施到您的工作流程中。
Bio-Techne和PROGEN推出新的简单Plex AAV2免疫测定法：
Progen提供各种抗体用于鉴别AAV感染的不同阶段以及rAAV的组装分析。艾美捷科技是PROGEN的经销商，为科研工作者提供优质的产品与服务。
https://www.amyjet.com/news/PROGEN-new.shtml
——————————————————
PROGEN-检测病毒衣壳蛋白VP1、VP2和VP3检测方案
PROGEN的AAV衣壳蛋白抗体识别病毒衣壳蛋白VP1、VP2和VP3的线性表位。AAV衣壳蛋白的高度序列相似性使得跨血清型的蛋白质易于检测。
图1显示了三种衣壳蛋白和相应的抗体结合位点。由于所有VP蛋白都由相同的阅读框编码，由于使用了交替的起始密码子和交替的剪接，它们仅在N端区域不同。结合C末端部分的抗体，如B1，能够结合所有衣壳蛋白，而像A1这样的抗体只能结合VP1，A69只能与VP1和VP2结合。
衣壳蛋白抗体可用于蛋白质印迹分析，以检测VP1、VP2和VP3的表达水平，以及使用色谱、免疫沉淀或免疫荧光进行蛋白质定位研究或蛋白质-蛋白质相互作用。
艾美捷PROGEN-衣壳蛋白抗体结合位点和反应性：
针对AAV2衣壳蛋白在小鼠体内产生的衣壳蛋白抗体，适用于所有检测变性VP蛋白线性表位的应用，如西方墨点分析（Western blot分析）。
Serotype Antibody Residues* Binding Site
AAV2 A1 123-KRVLEPLGL-131 Binding site is located at the N-terminus of the VP1 protein. Detection of VP1 only.
AAV2 A69 171-LNFGQTGDADSV-182 Binding site is located at the N-terminus of the VP2 protein. Detection of VP1 and VP2.
AAV2 B1 726-IGTRYLTR-733 Binding site is located at the C-terminus common to all three VP proteins. Detection of VP1, VP2 and VP3.
*氨基酸位置与VP1序列有关。
表位作图实验（Wobus等人，2000）确定aa123至aa131（N-末端；）是单克隆A1抗体的特异性结合区。
Wobus，C.E.等人。抗腺相关病毒2型（AAV-2）衣壳的单克隆抗体：参与AAV-2细胞相互作用和AAV-2感染中和的衣壳结构域的表位定位和鉴定。J.Virol。74, 9281–93 (2000).
交叉反应性：
Antibody AAV1 AAV2 AAV3 AAV4 AAV5 AAV6 AAV7 AAV8 AAV9 AAVrh10 AAV11 AAV12 AAVDJ
A1 x x x x x x x x x x x
A69 x na na na x
B1 x x x x x x x x x x
VP51 na x na na x na na na na na na na na
————————————————————————————
x-反应性
na-未分析
空场-无反应性
A1
与所有常见血清型AAV1-12的VP1蛋白发生反应。在免疫沉淀中，偶尔可以看到与非AAV衍生蛋白的反应。
B1
由于来自不同AAV的VP蛋白序列高度相似，B1抗体显示出与大多数测试过的AAV血清型的高交叉反应性。
使用AFDyes：
使用AFDye™标记的抗体，您可以在不使用第二抗体的情况下检测您感兴趣的蛋白质。这为您节省了宝贵的时间，因为您还可以通过使用不同标记的抗体（如AFDye 647和AFDye 488）同时检测同一样本中的不同蛋白质。
PROGEN为B1抗体提供两种不同的AFDye™偶联物：AFDye 647和AFDye 488。
Progen提供各种抗体用于鉴别AAV感染的不同阶段以及rAAV的组装分析。艾美捷科技是PROGEN的经销商，为科研工作者提供优质的产品与服务。
https://www.amyjet.com/news/PROGEN-new.shtml
——————————————————
Innovagen--β-淀粉样蛋白1-40抗体，神经元标志物
β-淀粉样蛋白1-40（Aβ1-40）是一种与阿尔茨海默病（AD）密切相关的蛋白质。它是由淀粉样前体蛋白（APP）经过β-和γ-分泌酶水解产生的，主要存在于大脑中，形成细胞外的蛋白质沉积物，即淀粉样斑块，这是AD的主要标志之一。
β-淀粉样蛋白1-40抗体通常由兔体内产生，属于多克隆IgG类型。这些抗体经过特异性抗原亲和纯化，能够特异性地识别并结合Aβ1-40的C末端，而不与Aβ1-42发生交叉反应。这种特异性使其非常适合作为捕获抗体，用于各种生物化学分析和研究，如酶联免疫吸附试验（ELISA）和西方墨点分析（Western blot）。
Innovagen--β-淀粉样蛋白1-40抗体：特异性与β-淀粉样蛋白1-40的C末端反应的兔多克隆抗体。不与β-淀粉样蛋白1-42发生交叉反应。适合作为捕获抗体使用。
艾美捷Innovagenβ-淀粉样蛋白1-40抗体：
名称：β-淀粉样蛋白1-40
宿主：兔
类型：多克隆IgG
纯度：特异性抗原亲和纯化
免疫原：与人类β-淀粉样蛋白1-40的C末端相对应的合成肽段，与载体分子标记。
免疫原与纯化：
这些抗体的免疫原是与载体分子共轭的、对应人类β-淀粉样蛋白1-40 C末端的合成肽段。通过这种方法，抗体能够高度特异性地识别目标蛋白，减少非特异性结合，从而提高实验的准确性和重复性。
检测方法：
β-淀粉样蛋白1-40抗体常用于检测人血清、血浆或其他相关生物液体中的Aβ1-40浓度。ELISA试剂盒是常用的检测工具，其检测原理是双抗体夹心ELISA法。这种试剂盒具有高灵敏度和特异性，能够在15.63-1000 pg/mL的检测范围内准确测量Aβ1-40的浓度。
Innovagenβ-淀粉样蛋白1-40抗体相关：
beta Amyloid 1-42 Polyclonal, Rabbit
beta Amyloid N-term Pyr11 Polyclonal, Rabbit
beta Amyloid N-term Pyr3 Polyclonal, Rabbit
beta Amyloid N-terminus Polyclonal, Rabbit
Innovagen专注于抗体、重组蛋白和合成肽的生产和开发。在Innovagen从事这一领域的30多年中，从数千个肽和抗体合成项目中获得了经验，将努力始终为用户提供高质量的材料和客户服务。艾美捷科技是Innovagen的中国代理商，为科研工作者提供优质的产品与服务。
https://www.amyjet.com/news/Innovagen-new.shtml
——————————————————
Innovagen--CAP-18抗体：人类Cathelicidin抗菌肽LL-37的生物学功能研究
CAP-18抗体是一种针对CAP-18（也称为LL-37）的多克隆抗体，主要用于科研领域。CAP-18是一种小分子抗菌肽，属于猫肝素素抗菌肽（Cathelicidin）家族，存在于多种哺乳动物中，包括人类。
CAP-18抗体通常由鸡体内产生，属于多克隆IgY类型。这些抗体通过特异性抗原亲和纯化，能够特异性地识别CAP-18肽段。CAP-18肽段是LL-37的兔同源物，LL-37是人类发现的Cathelicidin
CAP-18抗体的免疫原是合成的CAP-18肽段。这些肽段与人类CAP-18的特定区域共轭，用于诱导抗体的产生。CAP-18抗体在多种应用中表现出高度的特异性和亲和力，包括Western Blot（WB）、免疫荧光（IF）、免疫组织化学（IHC）和流式细胞术（FACS）
Innovagen--CAP-18抗体：针对合成肽段CAP-18的多克隆抗体，CAP-18是LL-37的兔同源物。
艾美捷Innovagen-CAP-18抗体：
名称：CAP-18
别名：CAP18
宿主：鸡
类型：多克隆IgY
纯度：特异性抗原亲和纯化
免疫原：合成CAP-18肽段。
文献参考：
Raqib, R., P. Sarker, P. Bergman, G. Ara, M. Lindh, D. A. Sack, K. M. Nasirul Islam, G. H. Gudmundsson, J. Andersson, and B. Agerberth. 2006. Improved outcome in shigellosis associated with butyrate induction of an endogenous peptide antibiotic. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103:9178-9183.
Innovagen-CAP-18抗体相关：
CAP-18 AP Alkaline Phosphatase (AP) labeled
CAP-18 biotin Biotinylated
CAP-18 FITC Fluorescein isothiocyanate (FITC) labeled
CAP-18 HRP Horseradish peroxidase (HRP) labeled
Innovagen专注于抗体、重组蛋白和合成肽的生产和开发。在Innovagen从事这一领域的30多年中，从数千个肽和抗体合成项目中获得了经验，将努力始终为用户提供高质量的材料和客户服务。艾美捷科技是Innovagen的中国代理商，为科研工作者提供优质的产品与服务。
https://www.amyjet.com/news/Innovagen-new.shtml
——————————————————
Innovagen--Dicer（人）抗体，提高实验的准确性和重复性
Dicer（人）抗体是一种针对人类Dicer蛋白的特异性抗体，广泛应用于分子生物学和细胞生物学研究中。
Dicer（人）抗体通常由兔体内产生，属于多克隆IgG类型。这些抗体通过特异性抗原亲和纯化，能够特异性地识别并结合Dicer蛋白。Dicer是一种关键的核糖核酸酶，参与RNA干扰（RNAi）途径，负责将双链RNA切割成短的RNA片段，即microRNA。
Dicer（人）抗体的免疫原是与KLH共轭的合成肽段，对应人类Dicer蛋白的第1382-1396个氨基酸。这些抗体在多种应用中表现出高度的特异性和亲和力，包括Western Blot（WB）、免疫荧光（IF）、免疫组织化学（IHC）、免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation）和流式细胞术（FACS）。
Innovagen--Dicer（人）抗体通过蛋白A和肽亲和层析等方法进行纯化，确保其高纯度和低非特异性结合，从而提高实验的准确性和重复性。
艾美捷Innovagen-Dicer（人）抗体：
名称：Dicer（人类）
别名：Dcr1同源物（果蝇）、内源性核糖核酸酶Dicer、解旋酶moi、HERNA、KIAA0928
宿主：兔
类型：多克隆IgG
纯度：特异性抗原亲和纯化
免疫原：与KLH共轭的合成肽段，对应人类Dicer蛋白的第1382-1396个氨基酸。
文献参考：
Provost, P., Dishart, D., Doucet, J., Frendewey, D., Samuelsson, B., & R dmark, O. (2002). Ribonuclease activity and RNA binding of recombinant human Dicer. The EMBO journal, 21(21), 5864-5874.
Wang, Y., Kato, N., Jazag, A., Dharel, N., Otsuka, M., Taniguchi, H., ... & Omata, M. (2006). Hepatitis C virus core protein is a potent inhibitor of RNA silencing-based antiviral response. Gastroenterology, 130(3), 883-892.
Innovagen-Dicer（人）抗体相关：
Dicer (human) AP Alkaline Phosphatase (AP) labeled
Dicer (human) biotin Biotinylated
Dicer (human) FITC Fluorescein isothiocyanate (FITC) labeled
Dicer (human) HRP Horseradish peroxidase (HRP) labeled
Innovagen专注于抗体、重组蛋白和合成肽的生产和开发。在Innovagen从事这一领域的30多年中，从数千个肽和抗体合成项目中获得了经验，将努力始终为用户提供高质量的材料和客户服务。艾美捷科技是Innovagen的中国代理商，为科研工作者提供优质的产品与服务。
https://www.amyjet.com/news/Innovagen-new.shtml