产品介绍
小RNA测序服务
小RNA是一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,主要包括miRNA、piRNA和siRNA等;它的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,在发育、病毒防御、造血过程、器官形成、细抱增殖和凋亡等环节起着重要调控作用。
小RNA转录组测序目标:
1. miRNA长度,茎环结构,miRNA前体加工,靶基因结合位点和预测;
2. 转录组和小RNA数据的联合分析。
一、技术流程
二、生物信息学分析内容
1. 测序质量分析与统计、评估;
2. microRNA,rRNA,tRNA,intron,exon,snRNA,snoRNA注释;
3. microRNA的表达量差异分析;
4. microRNA表达模式聚类分析;
5. microRNA保守性分析;
6. microRNA与靶基因之间的调控, microRNA靶基因之间的蛋白-蛋白相互作用网络分析;
7. 靶基因预测;
8. 新miRNA预测。
三、结果展示
1. 数据库使用
2. 版图展示
图1.1所示,反映样品间相似性,以及各miRNA的表达模式相似性;
图1.1 差异基因聚类热图
图1.2所示,预测miRNA;
图1.2 miRNA预测
四、样本要求
总量:〉4 μg RNA;浓度:〉50 ng/μL