产品介绍
无参考基因组的转录组测序
转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和。转录组测序能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程中的分子机理;目前已广泛应用于基础研究、临床诊断、药物研发和分子育种等领域。
无参转录组测序目标:
1. Trinity拼接,获得全面转录本信息
2. 检测稀有转录本和发现新的转录本
3. Unigenes 功能注释,差异表达
一、技术流程
二、生物信息分析内容
1. 测序质量分析与统计、评估
2. Trinity 拼接
3. Transcript功能注释
4. CDS预测
5. 基因表达定量分析、基因表达水平分析
6. 差异基因表达分析、差异表达基因GO富集分析和Pathway富集分析
7. SNP分析
8. SSR分析
三、结果展示
1. 数据库使用
数据库 | 网页链接 |
Swiss-Prot | http://web.expasy.org/docs/swiss-prot_guideline.html |
ORF预测 | http://emboss.sourceforge.net |
2. 版图展示
图1.1所示,反映出样品间的表达差异趋势不随表达量大小改变而变化
图1.1样本间的表达趋势
四、样本要求
总量:〉4 μg gRNA;浓度:〉50 ng/μL;260/280:〉2.0