产品介绍
转录组测序是针对特定组织或细胞在某一功能状态下所转录出来的所有RNA(包括mRNA和非编码RNA)进行测序分析的过程。通过新一代高通量测序技术一次性获得研究对象的全部转录本信息,进而可用于发现该样本转录水平上的结构和数量的差异,从而对这些差异信息进行深入研究。与传统的基因芯片技术相比,转录组测序无需预先设计芯片,便可对任意物种的任意细胞类型的转录组进行检测,提供更精确的数字化信号、更高的检测通量和更广泛的检测范围。目前转录组测序已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。
信息分析
数据产出统计,序列长度分布统计
与基因组比对情况统计
与已发布miRNA数据库的比对统计
与已发布ncRNA数据库的比对统计
统计不同种类的ncRNA所占比例
预测新的ncRNA
样品要求
合格
不合格(建库有风险)
RNA
1. OD260/280≧1.8 2. 28S/18S≧1
(植物参考25S/18S;原核参考23S/16S;特殊样品只有18S可不参考)
真核:总量≧3μg(两次建库),浓度≧50ng/μl 原核:总量≧10μg(单次建库),浓度≧65ng/μl 植物、真菌 RIN值≧6.5 动物 RIN值≧7.0 原核 RIN值≧6.0
(特殊物种,如没有28S,可以不参考,但Agilent 2100 图的基线要平整,RIN值最好可以达到7.0)
N/A 真核:总量≤3μg 原核:总量≤10μg RIN值≤7.0
注:
1、 如果样品OD值未达到要求:可能影响转录组建库时磁珠分离mRNA及反转录效率;可能对基因定量和文库随机性有轻微影响,导致duplication比例高。
2、 植物样品OD260/280、260/230达不到标准,但是差距不大,且样品呈不粘稠状态。
3、 为了确保项目的顺利开展,建议多提供一次建库的样品量。
圣庭集团致力于成为全球领先的基因组学、系统生物学和生物信息学研究解决方案提供者, 专注于开拓生物学、计算机科学和信息技术在微生物、动植物研究和人类健康领域的应用。…... 了解更多>>