产品介绍
长链非编码RNA（long noncoding RNA, lncRNA）指的是长度在200-100000 nt之间不具有蛋白编码功能的RNA分子（极少具有蛋白编码潜能），参与细胞内多种过程调控。具有跨物种的低保守性，组织特异性表达和丰度低等特点。近年来的研究表明，lncRNA参与了X染色体沉默，基因组印记以及染色质修饰，转录激活，转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，lncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。lncRNA的种类远远超过编码RNA，哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是lncRNA（相应的蛋白编码RNA的比例是1%-5%）。lncRNA已经成为非编码RNA研究领域的一个热点。通过lncRNA高通量测序，研究人员能够快速高通量的获得其与特定生物学过程或者疾病相关的lncRNA的表达变化，从而极大促进lncRNA的深入研究。
特征表现
1、lncRNA通常较长，具有mRNA样结构，有些具有poly(A)尾巴，有些没有poly(A)尾巴，分化过程中有动态的表达与不同的剪接方式，与编码基因相比，lncRNA表达量更低。
2、组织特异性：不同组织之间的lncRNA表达量不同。
3、时空特异性：同一组织或器官的不同生长阶段，其中的lncRNA表达量也会变化。
4、lncRNA启动子同样可以结合转录因子，如Oct3/4，Nanog，CREB，Sp1，c-myc，Sox2与p53，局部染色质组蛋白同样具有特征性的修饰方式与结构特征。
5、大多数的lncRNA在组织分化发育过程中，都具有明显的时空表达特异性，如有人针对小鼠的1300个lncRNA进行研究，发现在脑组织中的不同部位，lncRNA具有不同的表达模式。
6、在肿瘤与其他疾病中有特征性的表达方式。
信息分析
基本数据统计：去除接头污染、低质量序列得到clean data；去除核糖体RNA数据，数据产出统计及测序数据质量评估；
基因组mapping，转录本组装；
鉴定已知lncRNA（采用NONCODERv3、lncrnadb、Ensembl、NCBI、UCSC等多个lncRNA数据库的集合或者自定义数据库）；
预测新的lncRNA（PhyloCSF预测算法与CPC预测算法）；
lncRNA定量及差异表达分析（差异分析需至少2个样品）；
差异lncRNA靶基因预测（采用同源比对及RNAplex能量计算确定靶基因）；
lncRNA靶基因功能注释；
差异lncRNA靶基因的GO analysis；
差异lncRNA靶基因的pathwayanalysis。
定制分析
差异lncRNA与mRNA共表达分析；
结合客户的需求，协商定制其它定制化信息分析内容。
样品要求
1）样品类型：细胞、新鲜组织或RNA样品。
2）样品量：细胞样品请提供至少1×107个细胞，组织样品请提供至少300mg的组织块或切片，RNA样品请提供10 μg以上的总RNA。/p>
3）样品质量：RNA无明显降解，提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间，浓度≥ 500 ng/μl，28S:18S ≥ 1.5，RIN ≥7。
4）样品保存：细胞样品或新鲜组织块（切成~50mg的小块）可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后，-80℃保存。RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。
5）样品运输：样品置于1.5 ml管中，封口膜封好，干冰运输。
高通量：HiSeq2500高通量测序平台每次运行可产生600GB的数据量，效率高，成本低。
专业研究团队：硕士及以上学历的项目管理、技术研发和生物信息分析专家，拥有丰富的成功案例操作经验，可以为广大客户提供个性化的服务。
个性化分析服务：可根据客户的需求提供更为深入的生物分析结果。
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