产品介绍
全基因组从头测序（De Novo Sequencing）在没有参考基因组的情况下对某物种的全基因组进行测序和组装，从而绘制该物种的全基因组序列图谱。随着测序技术的发展，测序成本和测序时间大大降低，全基因组从头测序已经成为快速了解该物种的一个重要途径。尤其与人类生存相关的物种，如水稻、玉米、棉花等基因图谱的绘制完成，标志着我们可以从基因组水平对这些物种的生长、发育、进化、起源等问题进行研究，从而对基础生物学、分子育种、遗传基因改良等方面的研究起到巨大的推动作用。
信息分析
基因组拼接组装统计：原始数据统计、测序覆盖度统计Contig N50大小、基因组GC含量等信息
基因组注释：基因预测、功能基因注释（与Nt、Nr、Swiss-Prot、Interpro等数据进行同源比对）、重复序列分析及Non-coding RNA注释等
基因功能分析：包括GO富集分析、KEGG通路分析等
比较基因组学及进化分析：通过比较相近物种的基因组数据，从基因功能、基因组骨架结构、分子进化等方面对目标物种基因组进行深入分析）
样品要求
文库类型 | 浓度（ng/ul） | OD260/280值 | DNA需求量（单次） | 多次建库DNA需求量（建库N次） |
180bp insert | ≥50 | 1.8～2.0 | ≥3μg | 3 × (N+1) μg |
300bp insert | ≥50 | 1.8～2.0 | ≥3μg | 3 × (N+1) μg |
500bp insert | ≥50 | 1.8～2.0 | ≥3μg | 3 × (N+1) μg |
2K insert | ≥50 | 1.8～2.0 | ≥3μg | 3 × (N+1) μg |
5K insert | ≥50 | 1.8～2.0 | ≥3μg | 3 × (N+1) μg |
10K insert | ≥50 | 1.8～2.0 | ≥3μg | 3 × (N+1) μg |
20K insert | ≥50 | 1.8～2.0 | ≥3μg | 3 × (N+1) μg |
注： | 1、动植物全基因组de novo测序建议总DNA样品量不少于500ug； |
| 2、构建大片段文库，需根据脉冲场电泳检测结果，如果构建2-5k文库，主带要求在20k以上。如果构建10-20k文库，主带要求在40k以上。 |
来宝会员