产品介绍
环境微生物群落多样性分析,基于第二代高通量测序平台,对核糖体RNA高变区域,比如16S/18S/ITS等序列;或功能基因,比如细菌和古菌的氨氧化酶基因进行测序,揭示环境样品中众多不同类型微生物种类以及它们之间的相对丰度和进化关系。探讨微生物多样性,对于研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源利用有着重要的理论和现实意义。
信息分析
原始数据整理、过滤及质量评估
OTU列表生成及注释
基于物种丰度分析:稀释曲线、Alpha多样性分析、物种丰度差异分析、聚类分析(热图)、多元统计分析(根据实验设计)
基于群落结构分析:单样品物种分布、多样品物种分布、含进化关系的物种分布、 Beta多样性分析(PCoA、NMDS)
样品要求
1、环境样品
送样样品尽量保持新鲜,采样后建议立即冰冻保存
样品在保存期间切勿反复冻融
水样样品若是浑浊请在离心后送沉淀物,若是澄清水样请使用滤膜过滤后,送滤膜进行后续实验;若是样品中含有大量的腐殖质酸、重金属等PCR反应抑制剂,请在送样时注明
请务必填写完整的送样订单,并用自封袋密封后同样品一起送样,以便收到样品后妥善保存
2、环境基因组DNA
请提供浓度大于10ng/μl,总量大于500ng的基因组DNA,OD260/280=1.8-2.0,并确保DNA无降解
样品在保存期间请勿反复冻融
送样前务必清楚样品编号,并用parafilm膜对管口进行密封
高通量:HiSeq2500高通量测序平台每次运行可产生600GB的数据量,效率高,成本低。
专业研究团队:硕士及以上学历的项目管理、技术研发和生物信息分析专家,拥有丰富的成功案例操作经验,可以为广大客户提供个性化的服务。
个性化分析服务:可根据客户的需求提供更为深入的生物分析结果