来宝网移动站

产品介绍

宏基因组学（Metagenomics）又叫微生物环境基因组学、元基因组学。它通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA，构建宏基因组文库，利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。它是在微生物基因组学的基础上发展起来的一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质（或获得新基因）的新理念和新方法。其主要含义是： 对特定环境中全部微生物的总DNA进行克隆，并通过构建宏基因组文库和筛选等手段获得新的生理活性物质；或者根据rDNA数据库设计引物，通过系统学分析获得该环境中微生物的遗传多样性和分子生态学信息。

编码微生物的核糖体小亚基rRNA的DNA序列在结构上分为保守区和可变区。保守区反映生物物种间的亲缘关系，可变区反映物种间的差异。基于16S/18S/ITS rRNA基因信息的系统分类结果与基于全基因组信息的分类结果很相似，并且消除了克隆问题，可以综合研究各个可变区，分析方法也相对成熟，所以目前16S/18S/ITS rRNA基因作为最常用的生物标志物，广泛应用于微生物的系统进化、分类及多样性研究中。现在利用高通量测序技术研究环境微生物多样性的报道越来越多，这些系统的主要优点在于通量高，而且利用Barcoded PCR技术使得在一次运行中能同时进行多样本的大规模测序，使测序成本大大降低。

目前引物的选择很大程度上还是要根据经验，没有统一的标准，要根据测序平台的测序长度而选择适当的引物对。对于16S rRNA基因，我们推荐用515F/806R进行扩增，18S推荐用1391f/EukBr扩增，ITS1推荐用BITS/B58S3扩增。

Illumina HiSeq和MiSeq测序仪具有更高的通量，读长则相对较短，新型的MiSeq测序仪可以产生300 bp的序列长度，一次可以测定200个以上的扩增子样品，每个样品可以得到2万条以上的序列数，在微生物多样性研究中具有很大的应用潜力。