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GelGreen是专为凝胶染色设计的绿色荧光核酸染色试剂。它在凝胶染色上的灵敏度和SYBRGreen I相当，但和SYBRGreen I不同的是，无论是水解稳定性还是热稳定性，它都更加优异。而且和高诱变性的EB以及据报道有诱变增强作用的SYBRGreen I（Ohta et al. Mutation Reaserch 492, 91(2001)）不同，GelGreen已被证明没有诱变性和细胞毒性（完整的安全性报告可以从Biotium网站上下载）。观察到GelGreen低毒性的关键原因可能是由于该染料不能穿过细胞膜。GelGreen在250nm到300nm之间有充分的紫外吸收，并在500nm处出现强吸收峰。因此，GelGreen既可以和254nm UV凝胶成像系统兼容，也可以和可见光激发的系统兼容（如488nm激光凝胶扫描仪或Dark Reader）。
GelGreen既可用于预制凝胶也可用于电泳后染色。通常电泳后染色的灵敏度更高，并能排除染料对迁移的干扰从而排除了染料对核酸条带分离的干扰。相比而言，预制凝胶由于不需要额外染色过程，因此染料用量更少，更为简单经济。