Pathway富集分析（Pathway Enrichment)：
分析内容－对差异基因（P<0.05 或P<0.01）进行信号转导通路分析：
a.提供差异基因（P<0.05或P<0.01）基因的所有信号通路（Pathway)；
b. 富集分析前10个最重要信号转导通路（Pathway），并提供信号转导通路图。
c. 信号转导通路富集分析图（热图Heatmap+聚类Cluster）
信号转导通路富集分析
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KEGG信号转导通路
Pathway富集分析可以归纳总结出芯片实验数据的结果，显示出某一生理过程所采用的信号传递途径。
通过差异基因的Pathway 分析，可以找到不同样品间差异基因可能和哪些细胞通路的改变有关。通过芯片结果得到的是编码这些蛋白质的mRNA 表达量的变化；从mRNA 到蛋白表达还要经过microRNA 调控，翻译调控，翻译后修饰（如糖基化，磷酸化），蛋白运输等一系列的调控过程，mRNA 表达量和蛋白表达量之间往往不具有线性关系，因此mRNA 的改变不一定意味着蛋白表达量的改变。但Pathway富集分析的结果却可以提示研究者蛋白的活性和表达量的变化。这为后期的蛋白活性验证和蛋白表达量验证均有不可估量的预示作用。在某些pathway 中，如EGFR/ERBB 通路，细胞可以在维持蛋白量不变的情况下，通过蛋白磷酸化程度的改变（调节蛋白的活性）来调节这条通路。所以芯片数据pathway 分析的结果需要有后期蛋白质功能实验的进一步验证，如采用流式细胞检测细胞抗原、Western blot蛋白半定量检测、Elisa激酶活性检测，免疫组化（IHC），RNAi（RNA 干扰，miRNA）等技术手段做进一步深入的研究。
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