来宝网 2018/9/21点击857次
生物信息数据挖掘培训班
11月3-4日 北京
一．课程背景
高通量芯片及测序技术的快速发展和应用积累了海量的生物学数据，多个数据库诸如GEO、TCGA、ArrayExpress等被建立用来存储、查询以及分析挖掘有意义的生物信息。这些数据库具有免费、公开、操作界面友好的特点，几乎覆盖了所有器官、组织、细胞相关的基因组、转录组、表观组、蛋白质组等数据。了解这些数据库，掌握数据挖掘的相关技巧将有助于我们快速寻找靠谱的研究靶点，提高科研的质量和效率，发表高质量的SCI论文，奠定基金申请所需的前期工作基础等。
二．适用人群
通过生信大数据分析，提炼并研究科学问题的科研人员、研究生、博士生
有科研需求的临床医生
企事业单位的研发技术人员
三．课程特点
1.零基础入门级，无需生物信息学背景、无需编程能力，教你如何运用现有数据库挖掘有价值科研信息
2.交互式数据分析和探索，从多个数据源获取数据，并将数据转化为可用的形式
3.内容集中，通俗易懂，学完能够快速上手
4.理论与实操相结合，注重思路与案例带教齐头并进
四．课程内容
时间安排 | 课程表 | 介绍 | ||
2018年11月3日 | ||||
09:00-10:20 | 生物数据挖掘与科研 | 1. 生物数据挖掘概述 2. 常规高通量检测技术介绍 | 了解掌握生物大数据挖掘的背景知识 | |
10:40-12:00 | 常用数据库 | 1. 基因综合数据库NCBI 2. 基因表达数据库GEO | 掌握生物数据解读、查找和存储的能力 | |
13:30-15:00 | 差异表达分析 | 1. 方法介绍 2. 软件实现 3. GEO2R工具 4. 差异基因可视化 5. 火山图、热图绘制 | 无需编程，快速实现差异基因表达分析和可视化，掌握绘制火山图和热图的常规软件 | |
15:20-17:00 | 功能富集分析 | 1. 基本原理介绍 2. GO与KEGG数据库 3. 富集分析常用软件介绍 4. 功能富集分析结果可视化及解读 | 掌握GO、KEGG、DAVID等数据库的使用 | |
2018年11月4日 | ||||
09:00-10:20 | 基因/蛋白互作分析 | 1. 基因/蛋白互作数据库介绍 2. Cytoscape软件介绍与操作 3. 网络拓扑性质分析 4. 常用插件使用 | 熟练运用Cytoscape绘制高质量的基因/蛋白互作网络图，并掌握利用网络拓扑性质实现关键靶点的挖掘策略 | |
10:40-12:00 | 数据挖掘相关SCI文章解析 | 1. 研究靶点挖掘策略 2. 经典SCI文章套路解析 | 经典文章解析进一步理解数据挖掘的相关思路 | |
13:30-16:00 | 实操 | 1. 基因和蛋白基本信息查找 2. Blast序列比对 3. Primer-BLAST PCR引物设计 4. GEO数据库查找 5. GEO2R软件应用 6. 火山图绘制 7. 热图绘制 8. GO数据库查询 9. KEGG数据库查询 10. DAVID功能富集分析 11. STRING数据库挖掘互作关系 12. Cytoscape绘制基因互作网络 13. 关键基因（hub节点）寻找 14. MCODE子网络模块挖掘 | 通过自己动手进一步理解高通量数据挖掘的理念，掌握常用软件的使用。 | |
16:00-17:00 | 交流与答疑 | |||
五．讲师介绍：
陈博士，北京协和医学院博士毕业，目前在大型综合三甲医院专职科研，发表SCI论文十余篇，擅长生物信息学与基础医学交叉研究、数据库信息挖掘及数据可视化。
六．课程预期
1. 学会利用现有公共数据库挖掘相关疾病潜在靶点的思路
2. 掌握实现数据挖掘的关键软件
3. 数据可视化及高质量科研图片绘制
七．数据可视化示例
培训地点：北京好特热温泉酒店（地处丰台区方庄商圈，近三环路）
报名咨询：张依寒 13681810839 微信同号
邮箱：zhang.yihan@foxmail.com; wservice@acadeevent.com
