来宝网 2014/2/11点击1643次
在乌拉圭,葡萄品种Tannat可以酿造高品质葡萄酒被广泛的种植,Tannat浆果含有非常高的多酚类物质,生产出来的葡萄酒具有非常强烈的紫色和显著的抗氧化特性。科学家们通过采用Illumina technology测定UY11基因组序列,研究其与参考基因组的区别来探究这些显著性状的遗传学基础。
该文章由乌拉圭和意大利两国科学家合作完成,发表于The Plant Cell,文章的题目为“The High Polyphenol Content of Grapevine Cultivar Tannat Berries Is Conferred Primarily by Genes That Are Not Shared with the Reference Genome”
文章中,文库的制备和测序,DNA-seq和RNA-seq使用美国Sage Science公司的Pippin Prep 全自动核酸片段回收系统回收片段在350-550bp范围内。回收后用安捷伦公司DNA高灵敏度芯片检测确认文库质量,然后用Illumina公司HiSequation 1000测序仪完成分析。
Pippin prep全自动核酸片段回收系统可以自动化回收任意大小范围的核酸片段,不再需要手工切胶,也无需使用复杂配方的磁珠,cv值可至5-8%,文库片段准确性、重复性大大提升,简化了实验操作,促进了测序后数据分析的效率提升,是各种高通量测序文库构建的有力武器,在国外测序实验室已广泛作为标准配置设备。Sage公司产品支持各种主流测序平台,包括Illumina、Lifetech、Roche以及Pacific Bio等公司产品,有大量应用文献支持。
对于文库构建,Pippin prep还有以下优点:1.各片段回收完全独立,杜绝交叉污染;2.可以回收ng级微量或珍贵的DNA样本;3.回收好的DNA片段可以直接PCR文库扩增;4.结果可以是单一的回收峰,范围可以狭窄,非常nice。
环亚生物科技有限公司(APG Bio Ltd.)作为美国Sage Science公司全线产品在中国区的总代理,负责售前、售中和售后服务,努力为广大客户提供优质服务。欢迎新老客户与我司联系!如需要相关产品信息以及文献资料,可与以下地址联系:
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