来宝网 2014/2/11点击2127次
美国癌症基因组图谱计划（The Cancer Genome Atlas，TCGA）启动它的大规模协作途径，开展逐个器官癌症基因组分析时，大脑既是获益者，也是首要的挑战。TCGA联合来自14所机构的100多名科学家，对最常见及致命性的脑肿瘤：多形性胶质母细胞瘤（GBM）进行了研究，追踪了驱动GBM的基因组异常。
5年后，TCGA重访胶质母细胞瘤，生成了一张更广泛、更深入的驱动子和潜在治疗靶点图。研究结果发表在10月10日的《细胞》（Cell）杂志上。文章标题为“The Somatic Genomic Landscape of Glioblastoma” Cell. 2013 Oct 10;155(2):462-477。
文章在基因文库构建中是由美国布洛德研究所（Broad Institute）进行了全基因组DNA测序。用凝胶电泳或美国Sage Science公司的Pippin prep全自动核酸片段回收系统中厂家提供的方案对合适的片段进行大小筛选（范围为340-510bp）。之后到Illumina GAII 或者 HiSeq 测序仪上进行测序，测得101个bp碱基对。
Pippin prep全自动核酸片段回收系统可以自动化回收任意大小范围的核酸片段，不再需要手工切胶，也无需使用复杂配方的磁珠，cv值可至5-8%，文库片段准确性、重复性大大提升，简化了实验操作，促进了测序后数据分析的效率提升，是各种高通量测序文库构建的有力武器，在国外测序实验室已广泛作为标准配置设备。Sage公司产品支持各种主流测序平台，包括Illumina、Lifetech、Roche以及Pacific Bio等公司产品，有大量应用文献支持。
Pippin prep还有以下优点：1.各片段回收完全独立，杜绝交叉污染；2.可以回收ng级微量或珍贵的DNA样本；3.回收好的DNA片段可以直接PCR文库扩增；4.结果可以是单一的回收峰，范围可以狭窄，非常nice。
环亚生物科技有限公司(APG Bio Ltd.)作为美国Sage Science公司全线产品在中国区的总代理，负责售前、售中和售后服务，努力为广大客户提供优质服务。欢迎新老客户与我司联系！如需要相关产品信息以及文献资料，可与以下地址联系：
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