来宝网 2014/2/11点击2335次
组蛋白修饰一直是表观遗传学的研究重点方向之一。最近一篇发表在Nature主刊的研究发现,酵母组蛋白H2A 105号位置谷氨酰胺(Q105)的甲基化(在人H2A位置为Q104)作为一种rRNA的表达调控方式,直接影响转录复合物FACT与核小体的结合,是第一个被发现专一用于RNA聚合酶I转录调控的组蛋白表观遗传标记。
该文章由英国剑桥大学和丹麦哥本哈根大学的科学家合作完成,发表于2013年12月18日,文章标题为“Glutamine methylation in histone H2A is an RNA-polymerase-I-dedicated modification”,Nature 12819。
文章使用多种技术手段,其中包括ChIP-seq测序分析。在文库制备过程中,使用美国Sage Science公司的Pippin prep全自动核酸片段回收系统回收ChIP文库片段于350-600bp范围内。回收后用安捷伦公司DNA高灵敏度芯片检测确认质量,然后用Illumina公司MiSeq测序仪完成分析。
Pippin prep全自动核酸片段回收系统可以自动化回收任意大小范围的核酸片段,不再需要手工切胶,也无需使用复杂配方的磁珠,cv值可至5-8%,文库片段准确性、重复性大大提升,简化了实验操作,促进了测序后数据分析的效率提升,是各种高通量测序文库构建的有力武器,在国外测序实验室已广泛作为标准配置设备。Sage公司产品支持各种主流测序平台,包括Illumina、Lifetech、Roche以及Pacific Bio等公司产品,有大量应用文献支持。
对于ChIP-seq文库构建,Pippin prep还有以下优点:1.各片段回收完全独立,杜绝交叉污染;2.可以回收ng级微量或珍贵的DNA样本;3.回收好的DNA片段可以直接PCR文库扩增;4.结果可以是单一的回收峰,范围可以狭窄,非常nice。
环亚生物科技有限公司(APG Bio Ltd.)作为美国Sage Science公司全线产品在中国区的总代理,负责售前、售中和售后服务,努力为广大客户提供优质服务。欢迎新老客户与我司联系!如需要相关产品信息以及文献资料,可与以下地址联系:
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