2014年2月生命科学新增案例
来宝网 2014/3/11点击1213次
尊敬的客户，您好！
为了给客户提供更便捷的技术服务，创腾科技将会定期推出应用案例，供大家参考学习！
2月份共新增5个应用案例：
一、通过改变群体抑制酰化酶PvdQ的底物特异性减弱伯克氏菌的毒性
二、水稻MAPK提高产量作用机理研究
三、烟草钙调素样蛋白调节的植物抗病毒机制研究
四、采用Pipeline Pilot定制在线化合物片段计算工具3DFIT
五、Pipeline Pilot 科学数据的管理利器MongoDB
具体案例简介及免费注册链接：
| 案例名称 | 通过改变群体抑制酰化酶PvdQ的底物特异性减弱伯克氏菌的毒性 |
| 参考文献 | - |
| 软 件 | Discovery Studio |
| 研究方向 | |
| 简 介 | 一些酶通过干涉群体感应防止病毒感染。作者在绿脓假单胞菌中得到PvdQ，并将其作为模板进行突变得到一些能够有效水解信号分子C8-HSL。其中两个突变体（PvdQLα146W,Fβ24Y）能够有效的意志C8-HSL在伯克氏菌中的数量。从而达到较弱伯克氏菌毒性的作用。 |
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| 案例名称 | 水稻MAPK提高产量作用机理研究 |
| 参考文献 | PLos one. May 2013. Volume 8. Issue 5. e65011 IF=3.73 |
| 软 件 | Discovery Studio |
| 研究方向 | 生物大分子 |
| 简 介 | MAPK活化可以提高农作物的产量，本文采用DS Modeler和DS ZOCK的方法，对活化MAPK的MAPKK的作用机理进行了理论上的研究，并对研究结果进行实验上的验证，为MAPK的设计改造提供理论基础。 |
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| 案例名称 | 烟草钙调素样蛋白调节的植物抗病毒机制研究 |
| 参考文献 | PNAS, 2012, 109: 10113–10118. IF=9.737 |
| 软 件 | Discovery Studio |
| 研究方向 | 生物大分子 |
| 简 介 | 本文采用同源建模、蛋白表面静电势分析以及蛋白对接的方法构建了烟草钙调素样蛋白和病毒表达的RNA沉默抑制子TAV 2b的复合物模型，并分析了两者之间的作用模式，从而从模拟角度揭示了烟草中一种独特的病毒防御机制。 |
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| 案例名称 | 采用Pipeline Pilot定制在线化合物片段计算工具3DFIT |
| 参考文献 | Drug Discovery Today, Vol. 18, No. 23-24, 12.2013, p. 1221-1227. IF=6.551 |
| 软 件 | Pipeline Pilot |
| 研究方向 | 化学信息学 |
| 简 介 | 已知，基于分子片段的药物设计或筛选方法已被证实是一种高效的先导化合物发现方法。本文简单介绍了剑桥大学“3D Fragment Consortium”学术组织的专家是如何通过Pipeline Pilot定制名为3DFIT (3D Fragment Idea Tool)的在线计算工具，并用于分析化合物片段空间、创建3D片段库和实现组织内部信息共享等工作。 |
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| 案例名称 | Pipeline Pilot 科学数据的管理利器MongoDB |
| 参考文献 | - |
| 软 件 | Pipeline Pilot |
| 研究方向 | 数据管理 |
| 简 介 | 科研数据的数据结构种类非常多且往往很复杂，很难用关系型数据库进行数据的存储。Pipeline Pilot 9.0中新增了非关系型数据库MongoDB的相关功能模块。这使得它们能够灵活地处理各种数据类型，同时非常方便地保存各种科研数据，包括复杂数据结构和非结构化文档。 |
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