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2014年1月生命科学新增案例

来宝网 2014/1/16点击1253次

 尊敬的客户,您好!

      为了给客户提供更便捷的技术服务,创腾科技将会定期推出应用案例,供大家参考学习!

1月份共新增5个应用案例:
一、植物光敏素中发色团的生物合成机制研究
二、基于分子对接及分子动力学研究CysLT2受体拮抗剂作用机理
三、18β甘草次酸抗疟机理研究
四、Pipeline Pilot中自动实现Raman光谱的聚类分析与可视化
五、Pipeline Pilot整合SMARTCyp预测化合物的细胞色素P450代谢

具体案例简介及详情链接:

案例名称

植物光敏素中发色团的生物合成机制研究

参考文献

J. Biol. Chem. 2010, 285:5056-5065.  IF=4.651

    

Discovery Studio

研究方向

蛋白识别机理

    

本文采用同源建模和蛋白对接的方法构建了植物色素合成酶和铁氧还原蛋白的复合物模型,解释了两者之间的作用机制,从而研究了植物体内用于吸收和感应光源的发色团生物合成的机制。

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案例名称

基于分子对接及分子动力学研究CysLT2受体拮抗剂作用机理

参考文献

-

    

Discovery Studio

研究方向

虚拟筛选

    

作者研究CysLT2受体拮抗剂作用机理。首先通过同源建模构建受体结构,接着用分子对接及分子动力学的方法评估相互作用模式。最后基于分子对接筛选先导化合物。

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案例名称

18β甘草次酸抗疟机理研究

参考文献

PLos one. September 2013. Volume 8.Issue 9.e74761  IF=3.73

    

Discovery Studio

研究方向

蛋白识别机理

    

作者研究了18β甘草次酸抗疟机理。首先基于LibDockGA与抗疟靶标乳酸脱氢酶(plLDH)的进行对接,观察相互作用,并且对GA进行ADMET性质预测和类药性规则进行分析。

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案例名称

Pipeline Pilot中自动实现Raman光谱的聚类分析与可视化

参考文献

-

    

Pipeline Pilot

研究方向

光谱分析

    

本文中将介绍如何灵活地使用Pipeline Pilot的分析仪器功能模块中一系列的光谱数据读取、分析、建模和展示组件来搭建一个完全自动化的Raman光谱聚类分析和可视化的工作流程。

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案例名称

Pipeline Pilot整合SMARTCyp预测化合物的细胞色素P450代谢

参考文献

-

    

Pipeline Pilot

研究方向

计算化学

    

哥本哈根大学的Lars Olsen等开发了一种算法——SMARTCyp可以帮助科学家预测分子中的哪些原则更容易被CYPs代谢 。我们对该算法进行了整合,使其可以很方便地在Pipeline Pilot里面进行使用。

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