Snapshot法检测、SNP检测、单核苷酸多态性分析、片段分析
来宝网 2012/5/9点击3781次
SNP单核苷酸多态性分析Snapshot法优惠价10元/检测
|
服务编号
|
服务项目
|
内容说明
|
价格
|
周期
|
|
SNP01
|
TaqMan探针法
|
荧光定量PCR仪
|
15元/SNP
|
2-4周
|
|
SNP02
|
SNaPshot法
|
ABI 测序仪
|
15元/SNP
|
1-4周
|
|
SNP03
|
HRM法
|
荧光定量PCR仪
|
10元/SNP
|
1-3周
|
|
SNP04
|
MassArray法
|
Sequenom质谱仪
|
询价
|
2-4周
|
|
SNP05
|
BeadXpress法
|
Illumina BeadXpress
|
询价
|
10-15周
|
|
SNP06
|
数据分析服务
|
进行疾病关联性等群体遗传学分析
|
询价
|
1-2周
|
背景介绍：
SNP（single nucleotide polymorphism），即单核苷酸多态性，是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态。一般来说，一个SNP位点只有两种等位基因，因此又叫双等位基因。SNP在人类基因组中的发生频率比较高，大约平均每1000个碱基中就有一个多态位点。有些SNP位点还会影响基因的功能，导致生物性状改变甚至致病。单核苷酸多态性是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据，因此被广泛用于群体遗传学研究（如生物的起源、进化及迁移等方面）和疾病相关基因的研究，在药物基因组学、诊断学和生物医学研究中起重要作用。根据实验目的和通量的不同，瑞金特通过以下五种方式来提供SNP检测服务：
服务项目：
1. TaqMan探针法
针对染色体上的不同SNP位点分别设计PCR引物和TaqMan探针，进行实时荧光PCR扩增。探针的5’-端和3’-端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。当溶液中存在PCR产物时，该探针与模板退火，即产生了适合于核酸外切酶活性的底物，从而将探针5’-端连接的荧光分子从探针上切割下来，破坏两荧光分子间的PRET，发出荧光。通常用于少量SNP位点分析
2. SNaPshot法
该技术由美国应用生物公司（ABI）开发，是基于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术，也称小测序，主要针对中等通量的SNP分型项目。在一个含有测序酶、四种荧光标记ddNTP、紧临多态位点5’-端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中，引物延伸一个碱基即终止，经ABI测序仪检测后，根据峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点，根据峰的颜色可得知掺入的碱基种类，从而确定该样本的基因型。对于PCR产物模板可通过多重PCR反应体系来获得。通常用于10-30个SNP位点分析
3. HRM法
高分辨率熔解曲线分析（HRM）是近几年兴起的SNP研究工具，它通过实时监测升温过程中双链DNA荧光染料与PCR扩增产物的结合情况，来判断是否存在SNP，而且不同SNP位点、是否是杂合子等都会影响熔解曲线的峰形，因此HRM分析能够有效区分不同SNP位点与不同基因型。这种检测方法不受突变碱基位点与类型的局限，无需序列特异性探针，在PCR结束后直接运行高分辨率熔解，即可完成对样品基因型的分析。该方法无需设计探针，操作简便、快速，成本低，结果准确，并且实现了真正的闭管操作
4. Mass Array法
MassARRAY分子量阵列技术是Sequenom公司推出的世界上领先的基因分析工具，通过引物延伸或切割反应与灵敏、可靠的MALDI-TOF-MS技术相结合，实现基因分型检测。基于MassARRAY平台的iPLEX GOLD技术可以设计最高达40重的PCR反应和基因型检测，实验设计灵活，分型结果准确性高。根据应用需要，对数十到数百个SNP位点进行数百至数千份样本检测时，MassARRAY具有最佳的性价比，特别适合于对全基因组研究发现的结果进行验证，或者是有限数量的研究位点已经确定的情况。
5. Illumina BeadXpress法
采用Illumina公司的BeadXpress系统进行批量SNP位点检测，可以同时检测1-384个SNP位点，往往用于基因组芯片结果确认，适合高通量检测。微珠芯片具有高密度、高重复性、高灵敏度、低上样量、定制灵活等特点，极高的集成密度，从而获得极高的检测筛选速度，在高通量筛选时可显著降低成本。
送样要求：
细胞（≥106）、组织（≥300mg）、血液（≥1ml）、基因组DNA（体积≥20μl，浓度≥50 ng/μl）。
提供结果：
检测SNP的原始数据、数据分析结果及书面报告。
|
相关技术服务
|
||
|
服务编号
|
服务项目
|
内容说明
|
|
EXT01
|
DNA提取
|
从组织材料或血液等样本材料中提取基因组DNA，可应用液体工作站进行批量处理
|
|
EXT02
|
血清DNA提取
|
从1-5ml血清中提取游离DNA
|
|
EXT03
|
石蜡包埋组织DNA提取
|
从石蜡包埋的组织块中提取DNA
|
|
相关产品
|
|||
|
名称
|
品牌
|
规格
|
说明
|
|
快速qPCR Kit（TaqMan探针法）
|
|
1/5/10ml
|
能够在40分钟内完成反应，同时保证扩增效率和特异性
|
|
热启动Taq酶
|
|
250/500/1000U， 2.5U/μl
|
化学修饰，热启动，特异性极好，性价比很高
|
|
基因组DNA提取试剂盒
|
|
推荐仪器
 | |
