来宝网 2023/6/24点击513次
建库作为NGS测序的核心步骤,直接影响测序质量,文库转化率是评估文库质量的重要指标,高的文库转化率一定程度上意味着文库丰富度、测序数据均一性更好。常规T4 DNA Ligase催化DNA的 3’-OH 和接头的5’-磷酸基团之间形成磷酸二酯键完成接头连接,但此过程中会出现片段自连,从而减低文库转化率,影响文库丰富度与测序质量。翌圣ZymeEditor™酶改造平台对T4 DNA Ligase进行定向改造获得Hieff® 5' App T4 DNA Ligase(Cat#14960ES),该突变体只能以预苷化接头为底物进行接头连接,显著减少片段自连,提高文库转化率。
图1. NGS常规建库流程 产品特点 1、极低片段自连:只能以预腺苷化的接头为底物,极大降低片段自连。 2、超高接头连接效率:连接效率达95%以上。 3、严格质控:无切口酶、外切酶及RNase残留。 数据展示 图2. 以170 bp模式片段为底物连接效率检测 图3. 以300 bp模式片段为底物连接效率检测 图4. RNase残留检测 C:阴性对照 3、无切口酶及外切酶残留 将200 U Hieff® 5' App T4 DNA ligase与底物DNA孵育,琼脂糖凝胶电泳比较DNA谱带变化。结果显示翌圣Hieff® 5' App T4 DNA ligase无切口酶残留。 图5. 切口酶残留检测 C:阴性对照 将2000 U Hieff® 5' App T4 DNA ligase与底物DNA孵育,琼脂糖凝胶电泳比较DNA谱带变化。结果显示翌圣Hieff® 5' App T4 DNA ligase无外切酶残留。 图6. 外切酶残留检测 C:阴性对照 相关产品推荐 产品定位 产品名称 产品货号 末修加A UCF.ME® T4 DNA Polymerase (3 U/μL) 14457ES T4 Polynucleotide kinase(10 U/μL) 12902ES 常规接头连接 Hieff® Quick T4 DNA Ligase 10301ES 预腺苷化接头连接 Hieff® 5' App T4 DNA ligase 14960ES 文库扩增 Hieff Canace® Pro High-Fidelity DNA Polymerase(1 U/μL) 14382ES 翌圣ZymeEditor™酶改造定制服务 翌圣ZymeEditor™是一个酶改造底层技术平台,它基于翌圣生物多年在分子酶改造领域中的技术积累与知识拓展,该平台已具备对多种酶的多种需求进行定向改造的能力。因此,ZymeEditor™平台从2023年开始正式推出酶改造对外定制服务,可为各种应用领域(如医药、诊断、食品、化工等)的客户提供全套酶改造服务,也可以单独提供蛋白发酵及纯化工艺开发优化、规模化生产服务,以满足不同客户的需求,助力产业升级。 图7.ZymeEditor™酶改造定制服务流程