来宝网 2019/5/29点击1423次
MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina®
——建库试剂盒中的全能王
1、产品概述
Hieff NGS® MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina®,可用于NGS测序中DNA样本文库构建,采用高质量的酶学组成,改进型接头连接技术,以及具有强扩增效率的高保真酶,显著提高文库转化率与扩增效率,Input DNA范围为500 pg-1 μg,适用包含cfDNA、FFPE在内的所有样本进行文库构建,产品可以应用于全基因组测序、靶向捕获测序、Chip-seq等测序方法中。
2、产品特点
≥ 适用样本类型广:包含cfDNA、FFPE在内的所有样本均能获得优异文库和测序质量
≥ 应用范围广:产品可应用于全基因组测序、靶向捕获测序、Chip-seq等等
≥ 高品质酶学组成:业界领先的接头连接效率,高达60%、超高保真性和超强扩增效率
≥ 品质稳定:严格的批次性能与稳定性质控
3、操作流程
精简的操作步骤,2-2.5小时快速建库
4、产品优势
1)文库转化效率高达60%
图1 Agilent 2100 检测350bp平末端DNA片段单端和双端连接产物峰
0:350bpDNA片段峰、1:单端接头连接产物峰、2:双端接头连接产物峰。测试基于各公司的标准 protocol进行。
图2 接头连接效率百分比(%)。
对图1峰面积进行积分后的定量结果显示Hieff NGS™ MaxUp II Kit 的双端连接效率可达60%
2)扩增效率高,兼容不同GC含量样本
使用具有强扩增效率的Super CanaceTM High-Fidelity Mix用于文库扩增,效率更高。
产品名称 | GC 38% (ng) | GC 50% (ng) | GC 70% (ng) |
Super Canace® High-Fidelity Mix | 25.6 | 18 | 17.1 |
K*-HiFi mix | 15.8 | 16.7 | 21.1 |
1 ng GC含量分别为38%、50%、70%的400 bp DNA片段为起始样本,12 cycles扩增。
3)文库产量高
样本 | 100 ng FFPE | 5 ng cfDNA | ||
7 cycles (ng) | 10 cycles (ng) | 9 cycles (ng) | 12 cycles (ng) | |
MaxUP II | 400 | 2000 | 120 | 1200 |
K* 品牌 | 150 | 1100 | 100 | 1080 |
以FFPE和cfDNA为起始样本建库,相对同类型试剂盒品牌 K*,在相同扩增循环数下,获得更多文库产量。
4)数据无偏好性
在不同GC含量样本中,使用Hieff NGS™ MaxUP II Kit均能获得碱基质量好且覆盖度均一的测序数据。
样本 | Mapped Reads (%) | Coverage (%) | ||||
Average | 5× | 10× | 15× | 20× | ||
蜡状芽孢杆菌(GC 34%) | 93.8 | 99.644 | 99.643 | 99.641 | 99.639 | 99.638 |
大肠杆菌(GC 51%) | 92.7 | 93.057 | 92.782 | 92.687 | 92.625 | 92.579 |
嗜盐杆菌(GC 65%) | 94.2 | 99.598 | 99.028 | 98.391 | 97.885 | 97.419 |
图3不同GC含量样本测序偏好性图谱
5、客户反馈
5.1建库产量高
1)杭州某生物公司迈*
洗相同条件下对比实验,脱体积32 μL,对比文库产量,翊圣MaxUpII文库产量比K*文库产量更高
| MaxUp II | K* Hyper | ||||
Input DNA | 50 ng | 25 ng | 10 ng | 50 ng | 25 ng | 10 ng |
循环数 (cycles) | 7 | 9 | 13 | 7 | 9 | 13 |
文库浓度 (ng/µL) | 15.4 | 23.8 | 58.2 | 8.76 | 13.5 | 52.4 |
图4 对比文库质量峰图,翊圣MaxUpII文库主峰单一,大小与目的片段的大小一致,K*品牌建库试剂盒出现多峰的现象
2)北京某基因技术有限公司中*
gDNA样本(NA12878),平行实验中,翊圣建库试剂盒MaxUpII与K*品牌对比,文库质量和产量基本一致,在捕获建库中能兼容不同的捕获试剂!
样本名称 | Pre试剂盒 | Pre-pcr酶 | 起始投入量(ng) | Pre-pcr循环数 | Pre-pcr浓度(ng/μL) | 杂交捕获试剂 | Post-pcr循环数 | Post-pcr浓度(ng/μL) |
K1 | K* | K* | 100 | 9 | 116 | SureSelect XT | 11 | 3.62 |
K2 | K* | K* | 100 | 9 | 116 | 自制 | 11 | 5.58 |
Y1 | YEASEN | K* | 100 | 9 | 96 | SureSelect XT | 11 | 2.98 |
Y2 | YEASEN | K* | 100 | 9 | 95.2 | SureSelect XT | 11 | 2.62 |
Y3 | YEASEN | K* | 100 | 9 | 99.6 | 自制 | 11 | 6.14 |
Y4 | YEASEN | K* | 100 | 9 | 96.4 | 自制 | 11 | 4.88 |
5.2文库对应测序更为准确
1)上海某医学检验所渥*
Input DNA | ctDNA |
| ctDNA |
|
Library Prep Kit | K* Hyper |
| Yeasen MaxUp II |
|
Adapter | K* |
| Yeasen |
|
Clean Beads | AMPure XP |
| Yeasen |
|
Panel | homemade (0.7 M) | 肿瘤用药相关的区域 | homemade (0.7 M) | 肿瘤用药相关的区域 |
Target enrichment Kit | Roche NimbleGen |
| Roche NimbleGen |
|
Number of reads | 69,584,944 |
| 84,254,863 |
|
Mapped reads | 69,443,695 | 99.80% | 84,061,118 | 99.77% |
Duplicate Reads skipped | 33,619,961 | 48.31% | 36,539,873 | 43.37% |
Region size/percentage of reference | 603,967 | 0.02% | 603,967 | 0.02% |
Mapped reads(in region) | 37,974,721 | 54.57% | 46,955,235 | 55.73% |
Duplicated Reads(in region) | 23,393,464 | 61.60% | 28,074,535 | 59.79% |
Unduplicated mapped reads(in region) | 14,581,257 | 20.95% | 15,831,372 | 18.79% |
Coverage Mean | 30,324,926 |
| 32,898,505 |
|
Insert size P25/Median/P75 | 155/170/192 |
| 153/168/188 |
|
图5 K*品牌与翊圣MaxUpII建库试剂盒测序数据对比柱状图
订购信息
产品 | 货号 | 规格 | 价格(元) |
Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina® | 12200ES08/24/96 | 8/24/96libraries | 2456/6486/23567 |
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连接模块 | Hieff NGS® Fast-Pace DNA Ligation Module | 12607ES24/96 | 24/96 T | 2933/9773 | |
扩增模块 | 2×Super Canace® II High-Fidelity Mix for Library Amplification | 12621ES24/96 | 24/96 T | 583/1783 | |
接头 | 完整接头 | Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina, | 12615/6/7/8ES04/16 | 12×4/12×16 T | 1256/4536 |
短接头 | Hieff NGS® 96 Single Index Primer Kit for Illumina® | 12611/2ES02 | 48×2 T | 1493 | |
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磁珠 | DNA分选 | Hieff NGS® DNA selection Beads | 12601ES56/75 | 60/450 mL | 6286/26186 |
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