来宝网 2017/6/15点击1677次
cfDNA、FFPE等珍贵样本建库成功率低? 建库流程繁琐,耗时长? 测序偏好性大,覆盖度低?
Hieff NGSTM Nano DNA Library Prep Kit for Illumina?——专注珍贵样本建库
Hieff NGSTM Nano DNA Library Prep Kit for Illumina?是针对珍贵样本专业开发设计的,适用于Illumina?高通量测序平台的微量DNA建库试剂盒。本试剂盒主要通过采用高质量的组分构成、优化酶学反应条件、改良缓冲体系、简化DNA片段筛选方法、减少DNA转移次数等技术手段,突破了微量或珍贵样本进行常规DNA建库风险高、成功率低的瓶颈,实现了高效、稳定的微量DNA建库与测序。
? 低至50 pg DNA高效建库 ? 3小时内完成建库
? 更高的文库转化率 ? 获得更好的测序数据
? 极其适用于cfDNA、FFPE等珍贵样本建库
1)3小时内快速建库
图1 Hieff NGSTM Nano DNA library prep kit for Illumina?的建库效率高。
2)高的文库转化率
优秀的文库转化率意味着可以用更低的循环数得到足够上机测序的文库总量,同时降低文库构建过程中所引入的序列偏好性。
图2 Hieff NGSTM Nano DNA library prep kit for Illumina?的文库转化率达到国际一流水准。
样本:片段化E.coli gDNA。接头比例:按各款试剂盒中推荐的数值。测定方法:连接完整接头后,qPCR文库定量。
3)降低循环数
在获得相同产量文库时,使用的PCR循环数越少,表示试剂盒的建库效率越高。
表1 Hieff NGSTM Nano DNA Library Prep Kit for Illumina?的文库产出效率达到国际一流水准。
样本:片段化E.coli gDNA。接头比例:按各款试剂盒中推荐的数值。
Input DNA (ng) | Number of cycles required to generate | |||||
100 ng | 1000 ng | |||||
Yeasen Nano | 品牌K* | 品牌N*II | Yeasen Nano | 品牌K* | 品牌N*II | |
0.05 | 15 | -- | -- | -- | -- | -- |
0.1 | 14-16 | -- | -- | 17-18 | -- | -- |
0.5 | 11-12 | -- | 10-11 | 15-16 | -- | 14-15 |
1 | 10-11 | 13-15 | 9-10 | 14-15 | 17-19 | 12-13 |
10 | 7-8 | 7-9 | 6-7 | 11-12 | 11-13 | 9-10 |
50 | 3-4 | 3-5 | 3-4 | 7-8 | 7-8 | 6-7 |
100 | 2 | 2-3 | 2-3 | 6-7 | 6-7 | 7-8 |
4)获得优秀的测序质量
使用Hieff NGSTM Nano DNA Library Prep Kit for Illumina?和品牌N同类型产品用于大肠杆菌基因组DNA文库构建,并使用Illumina Hiseq 4000平台,以PE150模式进行测序。结果显示,Yeasen Nano在Q30、碱基质量、Mapped到的Reads比例、Coverage等方面达到国际一流水平。
表1 大肠杆菌K12菌株基因组DNA测序数据统计
Illumina Hiseq 4000, PE 150, reference genome: Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655
Samples | Clean Reads | Clean Base(G) | Q30(%) | Mapped Reads(%) | Coverage(%) | Average Depth(X) |
1 ng Yeasen | 6,864,846 | 1.045 | 91.40 | 90.40 | 94.83 | 175.54 |
1 ng 品牌N*II | 6,909,374 | 1.149 | 91.55 | 91.92 | 95.52 | 179.61 |
100 ng Yeasen | 6,667,866 | 1.018 | 91.83 | 92.25 | 96.92 | 187.34 |
100 ng 品牌N*II | 6,970,936 | 1.069 | 92.86 | 92.11 | 97.21 | 176.90 |
图3 1ng Yeasen样品测序数据Fastqc报告(左:序列质量分布;右:碱基分布)。
5)卓越性价比
Yeasen致力于为您提供性价比最高的产品!!
图4 Hieff NGSTM Nano DNA Library Prep Kit for Illumina?性价比更高。
产品 | 货号 | 规格 | 价格(元) |
Hieff NGSTM Nano DNA Library Prep Kit for Illumina? | 12202ES08 | 8 libraries | 2456.00 |
12202ES24 | 24 libraries | 6486.00 | |
12202ES96 | 96 libraries | 23567.00 |
更多产品信息请拨打400-6111-883或登陆http://www.yeasen.com/